使用ESTIMATE来对转录组表达数据根据stromal和immune细胞比例估算肿瘤纯度 / 四六文摘

三阴性乳腺癌的雌激素受体.孕激素受体.人类表皮生长因子受体HER2均为阴性,对内分泌治疗和HER2靶向治疗无效,治疗方法有限,预后较差,尤其非免疫炎症型肿瘤,被认为是"免疫冷淡型肿瘤&quo ...

多能干细胞可分化为各种细胞并构成成熟生物.这些细胞可以在体外培养,称为胚胎干细胞(ESCs). ESC在发育生物学上经历了一场巨大的革命.这些体外生长的ESCs具有在体内产生胚胎所有谱系的潜力,并且在 ...

编译:CCI,编辑:十九.江舜尧. 本微文由作者原创编译,欢迎转发转载. 浙江大学药学院范骁辉教授课题组于2020年5月21日在知名学术期刊Protein & Cell发表题目为<New ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 哺乳动物的胃肠道对于消化和吸收营养,能量代谢以及肠屏障的动态平衡和粘膜免疫至关重要.哺乳动物粘膜免疫系统的许多专门适应性进化已发展为与微 ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉费城儿童医院学者Kai Tan等人于2019年5月7日在<Genome Biology>上发表题目为<SCRABBLE: single-cell ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

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以前生信技能树发过这个教程: RNA-seq 检测变异之 GATK 最佳实践流程第一次对参考基因组建索引然后进行第一次序列比对之后根据第一次比对得到的所有剪切位点,重新对参考基因组建立索引再进 ...

通过前面的讲解,我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据,得到我们想要的表达矩阵,也学会了两个常用的套路分析得到的表达矩阵,就是GSEA分析和差异分析.也通过超几何分布检验的方法成功的理解了我们 ...

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