转录组表达数据分析的一些可视化 / 四六文摘

利用R包DEseq2进行差异表达分析和可视化 count数矩阵差异分析 1. 安装并载入R包 2. count数矩阵导入并对矩阵进行数据处理 3. 查看样本相关性并采用热图展示 4. hclust对 ...

介绍这么久的数据可视化,也一直在说利用Smartbi做可视化有着非常丰富的数据表达形式,包括图形.表格.文字.图片.照片等等.今天小编就来为大家介绍一下公司在制作可视化大屏的时候到底会用到哪几种数据可 ...

引言前面两期主要为各位简单介绍了转录组测序以及转录组测序的方法,相信各位对转录组测序有了一定的了解.那么测序后进行数据分析,具体包含哪些分析内容呢?本文就详细为各位介绍一下. 分析内容 mRNA是具 ...

对于基因表达而言,如果是常规的数据分析的话,目前网上已经有很多的工具可以来进行分析了.之前我们介绍的NetworkAnalyst就是这个类型的.这类的工具,彼此之间的区别也就是在于功能的多少.今天就 ...

文章发表于 (2013). "Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression da ...

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述)给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战: 所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期:表达矩阵的归一化和标准化,去除极端值,异常值 ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是学徒写的<GEO数据挖掘课程>的配套笔记(第5篇) B站课程<三阴性乳腺癌表达矩阵探索>笔记之文献解读三阴 ...

文献解读数据下载及理解差异性分析差异基因的富集分析 TNBC定义 PAM50的介绍在临床实践中,就需要HR阳性,HER2阴性乳腺癌的预后和预测模型,为了实现这些目的,基因检测,如Oncotyp ...

最近在读AUCell包的文档,链接是:http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AUCell.html,这个包的教程我已经写完了, 在 :使 ...

背景介绍早在2015年发表在Nat. Biotechnol文章就提出了 scLVM (single-cell latent variable model)来在单细胞转录组数据里面去除细胞周期影响但 ...

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