基于全基因组的基因家族分析（3）：SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列获取 / 四六文摘

来源:<中国科学报>2021-05-11 09:14 近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心韩斌院士团队与英国约翰·英纳斯中心研究团队合作,完成了禾本科.燕麦属一年生草本植物二倍体燕 ...

写在前面课题组目前做一些基因组相关工作.了解基因组的朋友应该明白,基因结构注释错误几乎遍布所有基因组,包括我们目前看到的大多数即使是发表在顶级期刊的工作.生物是复杂的,而算法是存在局限的.所以人工矫 ...

写在前面高通量测序技术普及,大量物种基因组被测序.组装质量逐步提高,但基因结构注释的质量则一如既往的让人担心.错误的基因结构注释,可能会使得你得到错误的结果.比如: 不准确的基因结构注释,使得编码蛋 ...

写在前面近年来,高通量测序费用持续走低.大多数课题组完全有经费可以支撑起自己所研究材料的基因组测序更或者可以非常容易地从网络上获取基因组序列与基因结构注释信息.于是会开始存在这样那样的,关于比较基因 ...

写在前面高通量测序已然成为qPCR一样普及到几乎每一个实验室.大量的物种被测序,对这些物种的序列信息进行分析,有助于我们更多地认识生物演化,预测更甚至了解基因的功能. 基于我个人的说法, 基因只是一 ...

写在前面这两天有看到几个用户朋友在生信札记讨论群中讨论了基因结构图的绘制.看到其他用户一直推荐 GSDS,我便也没有作声,毕竟 GSDS 确实是很优秀的网页软件.而现实情况是,近期 GSDS 网站无 ...

与常规的RNA-Seq一样,10x单细胞RNA-Seq/ST-Seq也需要测序数据比对到参考基因组进行基因的定量.那么参考基因组的质量就对单细胞的分析结果有着重大的影响. 接下来小编就给大家介绍一下1 ...

大家好,我是技能树的老朋友啦,三年前在群主的第一波RNA-seq入门8步活动中因为表现优异获得群主青睐成为技能树VIP一员,也开启了自己的学习经验分享人生! 转录组入门传送门考虑到技能树过于偏重于肿 ...

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易点评: 作为消化道常见恶性肿瘤之一,胰腺癌在肿瘤领域素有"癌症之王"的称号,据柳叶刀杂志记载,胰腺癌大多一经发现即为中晚期,确诊后的五年生存率约10%,是预后最差的恶性肿瘤之一. ...

皮刺是指植物表皮或皮层形成的尖锐突起,通常被认为是植物的防卫适应组织,保护植物免受动物.病原体或机械伤害.许多蔷薇科.豆科和芸香科等植物的茎杆.叶子和果实上都有皮刺,但幼嫩或发育早期的皮刺功能尚未得到 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在临床和科学研究中,血液都是人类进行分子分析的主要来源.它是许多治疗策略的目标,所以需要对构成人血的细胞进行全面的分子图谱分析.在这项 ...

这里选取的是 GATK best practice 是目前认可度最高的全基因组重测序分析流程,尤其适用于人类研究. PS:其实本文应该属于直播我的基因组系列,有两个原因把它单独拿出来, 首先,直播我 ...

推荐:江舜尧编译:艾奥里亚编辑:马莉美国康奈尔大学(Cornell University)Lei Gao等人于2019年5月13日在<Nature Genetics>发表题目为< ...

普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...

Genome-Wide Identification and Characterization of the CsFHY3/FAR1 Gene Family and Expression Analys ...

基于全基因组的基因家族分析（3）：SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列获取