改造IGV - 基于RNAseq测序数据 - 人工进行基因结构注释矫正 / 四六文摘

▼分类: 生物信息学1:软件网址:https://ccb.jhu.edu/software/glimmerhmm/2:下载近源物种的gff文件以及基因组序列,这个近源物种的寻找,个人的方法就是搞清楚你 ...

把我的全基因组重测续数据bam文件载入到IGV看了几个基因,发现有一些基因比对情况非常诡异,各种色块,各种缺口,让我不忍直视,搞得像是个破损的基因组,也查了查那些基因,主要是一些家族性基因,太长的基因 ...

不知道大家做生信分析的时候,有没有遇到做差异分析的时候没有得到一个差异基因的情况,反正笔者遇到过好几次,无论是GEO数据还是别人给的测序数据都遇到过没有差异基因,哪怕是使用最低的过滤标准都遇到过. 现 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

============================================ 写在前面:可以参考另外一篇<得到差异基因后怎么做?> ====================== ...

IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor,简称IGV-GSAme 写在前面 igv是目前最常用的本地基因组浏览器,与其开发的目标类似,用于整合各种类别的高 ...

写在前面这大半个月我都在医院待着,确实无法做太多事情,于是选择看一些文献.选择的是目前开发最完善,且可以说是在IGV-GSAme[之前我改造的IGV版本]出现之前的唯一一款基因结构注释人工矫正软件- ...

普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...

基本原理讲解随着测序技术的发展,我们可以通过二代测序的技术来预测m6A.关于m6A测序的技术叫做meRIP-seq,这个测序结果的分析,类似于chip-seq,最后我们可以获得一种叫做peak的文件 ...

在现代测序技术的帮助下,微生物组研究的范围被扩大,通过16S rRNA测序或鸟枪法宏基因组测序可以生成大量的微生物组数据.而微生物群落研究中的一个重要问题是对这些微生物的归类,模拟和分析人类微生物群. ...

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