技术贴 | R语言只画图例不画图 / 四六文摘

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22492 我们将使用葡萄酒数据集进行主成分分析. 数据数据包含177个样本和13个变量的数据框:vintages包含类标签.这些数据是对生长在意大 ...

什么是生信?提起生信,相信大家又爱又恨,得不到的永远在骚动.爱是不用做实验就能发原创研究,好棒啊.恨是看不懂那一大串代码,不会操作. 目前,不做实验发文章的主要有两大类:Meta分析,生信.其中生信文 ...

曾记否,咱们一起讨论过calibration curve,也就是校准曲线,校准曲线其实是实际发生率和预测发生率的散点图.还记得logistic回归的calibration curve怎么做吗?链接在此 ...

利用R语言堆叠图,我们可以将一个项目中所有样品的物种组成展示出来.下面介绍如何利用R语言进行物种组成分析和可视化.过程分为以下几步: 1)模拟丰度矩阵: 2)模拟分组: 3)标准化丰度: 4)调整格式 ...

导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...

简介:R语言统计与绘图公众号目前致力于分享医学统计与R绘图知识,手把手教你使用R语言绘制基线特征表.KM生存曲线.森林图.ROC曲线等.每天一篇精彩R语言推文教程,手把手带你入门R语言绘图. 今天推文 ...

本文由yang根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在组学数据挖掘中在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是G ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用psych包计算两组小样本的相关性并进行热图可视化,但当样本数据量非常大时,psych包会耗费的时 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在多组学数据关联挖掘中,在我们筛选到目标基因集以及目标蛋白质集合或目标代谢物集合后,在进行基因与蛋白质或代谢关联 ...

本文由微科盟阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例介绍如何用R语言gggenes函数包把基因预测得到的gff或gtf文件(含基因位置信息)中的基因类型.位置可视化 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例展示R语言组学关联分析的方法.宏基因组数据以KO-样品丰度表为例.代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例.基 ...

技术贴 | R语言只画图例不画图