技术贴 | R语言:手把手教你如何画ggplot堆叠图、冲积图、分组分面、面积图
相关推荐
-
【R绘图】ggplot2---调整绘图区域大小
熟悉R绘图的朋友肯定知道,在普通绘图中,图片的大小可以直接在png()和pdf()中指定,而绘图区大小则可以用par()中的mar或mai来指定. 但是在ggplot2中,图片大小依然可以在png和p ...
-
gg.gap:ggplot阶截断坐标轴的优秀完美解决方案
写在前面 ggplot的截断坐标轴一直以来做的不是很好,plot可以有一些比较复杂应用的函数可以解决截断坐标轴问题,但是ggplot出的大部分图表似乎无能为力.这里为大家介绍gg.gap包,用于ggp ...
-
技术贴 | R语言:构建一个转录代谢互作调控网络:(二)热图的美化以及大样本分组信息的快速注释
本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...
-
技术贴 | Excel:手把手教你如何做扩增子菌群数据与表观数据相关性热图
本文由技均根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 扩增子是一种较为经济的微生物测序方法,时常被广大科研工作者所选择.在进行数据分析时,需要将菌群数据与表观数据做相关性分析,来 ...
-
技术贴 | R语言:手把手教你画pheatmap热图
导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...
-
技术贴∣Excel:手把手教你如何用AI实现Excel数据高清图片生成
本文由微科盟技均根据实践经验而整理,希望对大家有帮助.微科盟原创微文,欢迎转发转载.在上篇技术贴"手把手教你如何做扩增子菌群数据与表观数据相关性热图"中,我们通过Excel进行了相 ...
-
技术贴 | R语言:如何绘制合并气泡图?
本文由yang根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在组学数据挖掘中在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是G ...
-
技术贴 | R语言:大样本多组学的相关性计算、热图绘制
本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 上期介绍了利用psych包计算两组小样本的相关性并进行热图可视化,但当样本数据量非常大时,psych包会耗费的时 ...
-
技术贴 | R语言:小样本多组学的相关性计算、热图绘制
本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在多组学数据关联挖掘中,在我们筛选到目标基因集以及目标蛋白质集合或目标代谢物集合后,在进行基因与蛋白质或代谢关联 ...
-
技术贴 | R语言:绘制基因组基因箭头图
本文由微科盟阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例介绍如何用R语言gggenes函数包把基因预测得到的gff或gtf文件(含基因位置信息)中的基因类型.位置可视化 ...
-
技术贴 | R语言:组学关联分析和pheatmap可视化
本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例展示R语言组学关联分析的方法.宏基因组数据以KO-样品丰度表为例.代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例.基 ...
