在单细胞转录组表达矩阵里面去除细胞周期影响 / 四六文摘

一.单细胞single cell RNA-seq简介 1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq) Measures the average expression level for each ...

最近在读AUCell包的文档,链接是:http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AUCell.html,这个包的教程我已经写完了, 在 :使 ...

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述)给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战: 所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期:表达矩阵的归一化和标准化,去除极端值,异常值 ...

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学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是<生信入门第7期>学员的分享最近看到有一个简单的数据挖掘文章,就做了一个单细胞表达矩阵的差异分析,然后强行解释一波.而 ...

在朋友圈看到了有人吐槽她下载的表达矩阵里面出现日期基因,挺好玩的,就把gse号码要过来了,是 GSE122083,其日期基因如下: 日期基因我看了看 GSE122083 数据集背后的文献,居然是单细 ...

多个样本单细胞转录组数据整合算法以 mutual nearest neighbors (MNNs)和canonical correlation analysis (CCA) 最为出名,见详细介绍多个 ...

正文文章的第一次分群按照 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), stromal (CD10+,MME,fibo or C ...

rm(list = ls()) ## 魔幻操作,一键清空~ options(stringsAsFactors = F)#在调用as.data.frame的时,将stringsAsFactors设置为 ...

在单细胞转录组表达矩阵里面去除细胞周期影响