scRNA-seq数据的处理—STAR / 四六文摘

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读免疫细胞的多样性.特异性.可塑性以及适应性这些特性使得它们对内稳态.特异性应答以及机体面对威胁变化发挥重要作用.单细胞测序技术,包括单 ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

Bowtie官方介绍: http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml Bowtie是一种超快速,高效存储的短reads比对工具.它以每小时超过2500万个 ...

编译:YQ,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞测序(SCS)影响了许多癌症研究领域,并提高了研究人员对肿瘤内异质性.肿瘤微环境.转移和治疗耐药性的理解.SCS技术的发展和完 ...

作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,积累了大量研究数据.Cell BLAST是一个自带高质量参考数据库的scRNA-seq数据检索/注释工具.这个网站由北京大学的研究团队 ...

前些天我在生信技能树介绍过star-fusion:最好用的融合基因查找工具终于正式发表了 ,然后在另外一个教程:一个好像没有做任何改变的参数提到了目前大量的单细胞转录组数据出来了,却没有一个文章去探 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 前情回顾 Seurat 4.0 ||您的 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 前情回顾 Seurat 4.0 ||您的 ...

编辑:技术君 | 来源:机器之心巧正文 OCR 方向的工程师,一定需要知道这个 OCR 开源项目:PaddleOCR.短短几个月,累计 Star 数量已超过 7.2K,频频登上 Github Tre ...

排除人为故意,检验报告中的结论不正确或数据不准确也时有发生,一般来说,问题主要出在这几个方面: 1检验和计算粗心大意检验是一个需要专注的过程,稍有疏忽,就容易出现差错.而随着手机的普及,检验过程中, ...

宇宙大千世界,它到底有多大,下面就让我们以星球大小对比的方式来看看这三千大千世界吧.虽然我们以为自己的星球非常之大,但殊不知在茫茫大千世界里,地球也不过沧海一粟,而人类呢可想而知. 宇宙大千世界,它到 ...

我国农业由于长期.大量并依赖性地使用化学肥料,已经将我们本来健康.肥沃的土地"喂"得板结.酸化.盐渍化.地力衰竭,其恶化程度触目惊心! 大家感受颇深的就是"化肥用量增加而 ...

CDA数据分析师出品编译:Mika [导读]你真的读过你使用app的条款和条件吗?挪威消费者委员会的Finn Lützow-Holm Myrstad和他的团队就读过.他们花了将近一天半的时间阅读了 ...

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