bowtie2软件构建基因组索引 / 四六文摘

我都忘记了自己的NGS流程系列增加了一个miRNA测序数据分析: 免费视频课程<RNA-seq数据分析> 免费视频课程<WES数据分析> 免费视频课程<ChIP-seq数 ...

我的全基因组数据还没拿到,而且还会推迟,简单说(tu)明(cao)一下原因(还好当初为了避免广告嫌疑一直没说是哪个公司负责测序,反正用的是illumina的hiseqX10这个测序啦,所以可以尽情的吐 ...

主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的 http://www ...

前些天我在生信技能树提出来了一个转录组数据分析的疑难杂症:RNA-seq的fastq文件里面为什么有gc含量的双峰,就是fastq测序数据质量控制的时候发现了GC含量的双峰,然后我简单分析了那些高重复 ...

一.在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列. 二.在创建好的文件夹下面,比如我的是 /Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/6/7/8/9 ,里面 ...

首先,下载所需物种的参考基因组大概可以去 UCSC http://www.genome.ucsc.edu/ 或者 ensembl http://asia.ensembl.org/index. ...

虽然说我的大部分教程是针对人类或者小鼠的数据分析,实际上这些分析很容易迁移到其它物种,可能比较麻烦的就是最上游的关于参考基因组和注释文件信息的选择吧,这里讲一下猫猫狗狗的数据分析吧! 首先搜索了解物种 ...

郭伟龙,中国农业大学副教授,主要以小麦为研究对象,结合基因组学.生物信息学.表观遗传学的手段,开展一系列原创性研究.已开发的DNA甲基化数据比对工具BS-Seeker2和和分析软件包CGmapTool ...

作为中国领先的医疗健康云服务运营商,冠新软件在2021未来医疗100强大会上入选"2021未来医疗100强·中国数字医疗榜". 冠新软件成立于2005年,是基层医疗卫生信息化.国家 ...

软件是怎么产生的? 表面上看,软件是由程序员在电脑中运行的开发平台上敲击代码产生的,但实际上它是程序员的大脑中产生的. 程序员首先是在大脑中构建了软件的架构,设计了每个单元.函数如何实现,之后把这些成 ...

山东大学海洋科学与技术研究所于2018年8月28日在<Bioinformatics>发表了题目为<NCycDB: a curated integrative database for ...

发布时间:2020年11月30日 13:34 来源:中新网甘肃中新网甘肃新闻11月30日电(通讯员曹倩芸)随着大环境的带动.丝路沿线资金的汇集.技术的转移和市场的对接,甘肃形成了一批特色优势产 ...

郭伟龙,中国农业大学副教授,主要以小麦为研究对象,结合基因组学.生物信息学.表观遗传学的手段,开展一系列原创性研究.已开发的DNA甲基化数据比对工具BS-Seeker2和和分析软件包CGmapTool ...

构建物种间的联系,还原物种之间的系统发育关系一直都是分类学家与演化学家的理想(#毕竟看起来应该是可以实现的).物种之间的关系能复杂成怎样?例如了解演化的小伙伴一定见过的:非洲大裂谷三大湖里短时间内爆发 ...

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