【直播】我的基因组（五）:测试数据及参考基因组的准备 / 四六文摘

一日一条命令-kneaddata 写在前面 kneaddata是一分结合质控和去除宿主的过程,集合了两个软件Trimmomatic和 Bowtie2,Trimmomatic作为质控软件应用的非常多,但 ...

来源地址:https://blog.csdn.net/xxxie_/article/details/100111991 欢迎订阅WX众号:基因学苑,更多精彩内容等你发掘! 基因学苑Q群:3279872 ...

准备好基因组的文件及hg19.fa,然后调用bowtie2. #hg19.fa 基因组fa文件 #hg19 索引前缀 #bowtie2-build 构建参考基因组索引文件 $bowtie2-build ...

bowtie2 语法很重要!!!! Usage: bowtie2 [options]* -x <index> {-1 <m1> -2 <m2> | -U <r ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

故事的开始是这样的~ 看我如何用5个小时才解决了Jimmy老师5秒钟就帮我搞定的问题~ 作为学徒的我这两天在跑Jimmy老师给的ATAC测试数据 ATAC测试数据和chip-seq套路一样,第一步. ...

来源:光明网-<光明日报>2021-05-09 02:31 X 我科学家绘制出高精度亚洲猪参考基因组图谱有助于新品种培育改良光明日报北京5月8日电记者杨舒8日从中国农业科学院获悉,该 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读蛇咬毒害是一种严重而被忽视的热带病,每年造成约10万人死亡.对毒素基因进行高质量基因组的全面表征将有助于开发有效的人源化重组抗蛇毒血清 ...

推荐:江舜尧编译:杨雅媛编辑:马莉福建省水产研究所海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室黄种持团队于2019年7月20日在<Moclecular Ecology Resources>发 ...

一.人类基因组有多大参照UCSC提供的hg38版本,也是目前常用的人类参考基因组 http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg3 ...

编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读全面.高质量的参考基因组对于人类肠道菌群的功能特性和分类学分配研究至关重要.该研究提供了统一的人类肠道微生物基因组(UHGG)数据 ...

本文由国服王昭君编译,玛莉.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读参考基因组对于人类肠道微生物群的宏基因组分析和功能特征分析是必不可少的.我们提出了可培养基因组参考(CGR)数据集,从来自健康 ...

工业互联网专业委员会委员,广东省玻璃协会副会长,顺德机械商会副会长,顺德机器人协会副会长,伦教玻璃协会副会长,NLP国际导师,ACMC国际认证教练,EDP联盟讲师,企业CEO教练,中国建筑玻璃与工业玻 ...

红花(Safflower, Carthamus tinctorius)属于菊科,因含有高亚油酸和黄酮受到食品及中医药研究者的广泛关注.作为不饱和脂肪酸,亚油酸具有降血脂.预防动脉粥样硬化等功效,亚油酸 ...

【直播】我的基因组（五）:测试数据及参考基因组的准备