浅析R语言非参数检验的多组比较及分面与分组的图形艺术 / 四六文摘

作用:从某日期减去指定的时间间隔后的日期用法:date_sub(date, interval expr type); date 参数是合法的日期表达式.expr 参数是希望添加的时间间隔. sel ...

五月份的学徒专注于GEO数据库里面的表达量芯片数据处理,主要的难点是表达量矩阵获取和探针的基因名字转换,合理的分组后就是标准的差异分析,富集分析.主要是参考我八年前的笔记: 解读GEO数据存放规律及下 ...

原文 http://tecdat.cn/?p=3740 有许多分层数据的例子.例如,地理数据通常按层次分组,可能是全球数据,然后按国家和地区分组 .一个生物学的例子是按物种分组的动物或植物的属性,或者 ...

以第一个基因为例,根据group_list来检验在分组之间是否存在差异 load(file='step1-output.RData') dat[1:4,1:4] table(group_list) # ...

前面我们演示了:泛癌分析时候的大样本量多分组建议选择tSNE而不是PCA,整合全部的33种癌症的仅仅是蛋白质编码基因的表达量矩阵,进行降维聚类分群可以看到并不是严格的各个癌症泾渭分明. 其中很明显乳腺 ...

肿瘤免疫微环境我们讲了很多了,目录是: estimate的两个打分值本质上就是两个基因集的ssGSEA分析针对TCGA数据库全部的癌症的表达量矩阵批量运行estimate 不同癌症内部按照estim ...

"R实战"专题·第7篇编辑 | 科白维尼 1898字 | 4分钟阅读本期推送内容相关性分析通常用来定量描述两个变量之间的联系,正相关?负相关?不存在相关?等.常见相关 ...

学徒已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是YuanSH的分享首先要了解一下什么叫批次效应那么如何解决批次效应呢? limma 包中 removeBatchEffect 函数中出 ...

结业考核20题:https://mp.weixin.qq.com/s/lpoHhZqi-_ASUaIfpnX96w 课程配套资料文档在:https://docs.qq.com/doc/DT2NwV0F ...

昨天的我可以为你做些什么好像阅读量不高,不过效果还是蛮显著的,跟部分粉丝聊了聊,希望对他们有帮助吧! 我们的生信故事会一直在征稿,详见:生信故事会栏目征稿启事下面分享一下最新投稿,讲述跨专业转行学习 ...

浅析R语言非参数检验的多组比较及分面与分组的图形艺术