泛癌水平的批量生存分析 / 四六文摘

众所周知,癌症具有异质性,在乳腺癌领域,不同亚型的癌症比不同器官来源癌症的差异要大很多.最简单癌症分类,当然是一个基因,比如ER阳性或者ER阴性的乳腺癌患者,并不是说人类有2万多个蛋白编码基因就可以有 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

朋友圈经常就被刷一个生存分析的教程,感觉都成月经帖了!关键是也没有讲什么新颖的东西,无非就是某个新的网页工具的用法,实在是太low了.必须得从我这里结束它们~ 很久以前我们这个公众号推出过一个生存分析 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

前言年前我提出了一个问题:为什么不用TCGA数据库来看感兴趣基因的生存情况就是一篇文章并没有使用TCGA数据库的指定癌症的生存信息去看自己感兴趣的基因的生存效应,反而舍近求远去下载BMC Canc ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miR ...

在前面的教程:居然有如此多种癌症(是时候开启pan-cancer数据挖掘模式),我们把全部的TCGA的33种癌症的表达量矩阵区拆分成为蛋白编码基因和非编码基因这两个不同的表达量矩阵,并且保存成为了rd ...

靶向药的使用显著提高了EGFR突变阳性晚期NSCLC 患者的生存率,然而大多数患者用药一段时间后无法避免会出现疾病进展.基于临床进展模型克服耐药性的治疗策略是精准靶向治疗的基石.Yang等根据疾病控制 ...

泛癌水平的批量生存分析