参考基因组用错了单细胞转录组流程照样可以走通 / 四六文摘

浩瀚星空吸引着人们进行探索.在转录组学中,空间分辨率也开辟了新的世界. 导读空间转录组学是单细胞分析后的下一波热潮,这是一个非常活跃的领域,新的技术开辟了新的科研角度.该技术不仅可以获取转录组数据并 ...

2020年11月,来自美国国立卫生研究院(NIH)的表观生物学家赵可吉教授,在Nature Reviews Genetics发表综述,全面解析了当前高通量表观测序技术如何用于细胞异质性的研究,以及罗列 ...

垂体是最重要最复杂的内分泌腺体之一,主要由五种激素细胞组成,包括生长激素细胞.催乳素细胞.促甲状腺素细胞.促肾上腺皮质激素细胞和促性腺激素细胞,在生长发育.代谢调节.生殖以及应激等生理过程中发挥重要作 ...

2016年,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所.瑞典皇家理工学院等研究机构的学者们在<Science>上发文,阐述了一种新的转录组学研究技术,并提出了"空间转录组学"的概念.虽然 ...

这是<肠道产业>第 469 篇文章编者按: 基因表达具有时间特异性和空间特异性.时间特异性通常可以通过对不同时间点的样本取材,再使用单细胞转录组测序技术来进行解析.然而,空间特异性信息常 ...

背景介绍目前,单细胞转录组技术已成功应用于解析肿瘤微环境(TME)中正常细胞和肿瘤细胞的亚群和基因表达.同时,随着高通量测序技术的发展,使并行检测数以万计的单细胞转录组信息也成为可能. 然而,大 ...

问题一:如何利用肿瘤微环境提高靶向治疗的疗效? How can we harness the tumor microenvironment to improve cancer therapies ? ...

这两天在筹备给中科院上海生化细胞所曾安研究组招聘生物信息学相关人才,就跟曾老师多聊了几句.(画外音,很多人也喊我曾老师,感觉两个曾老师聊天有点诡异)尤其是他2018年cell的单细胞转录组文章,关于涡 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读蛇咬毒害是一种严重而被忽视的热带病,每年造成约10万人死亡.对毒素基因进行高质量基因组的全面表征将有助于开发有效的人源化重组抗蛇毒血清 ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

四年前我做了一个单细胞课程,就是对scRNAseq包里面的数据示例的一些处理. 不过那个时候的R包的很多函数代码现在都过时了,现在没有学习的价值了哈,但是思路是可取的, 比如我把单细胞转录组数据分析流 ...

在华为云服务器可以重现这个分析流程,16核64G内存,不考虑数据下载环节,5天即可完成文章全部分析环节. 背景自学最先在生信技能树有过一些教程: 10X genomics单细胞数据集探索 10x的单 ...

前些天我在生信技能树介绍过star-fusion:最好用的融合基因查找工具终于正式发表了 ,然后在另外一个教程:一个好像没有做任何改变的参数提到了目前大量的单细胞转录组数据出来了,却没有一个文章去探 ...

如果你想亲手分析自己的数据,生信技能树联合单细胞天地也推出了:7个小时的单细胞转录组视频课程(限时免费) 足足7个小时,34集,涵盖了单细胞转录组背景知识以及数据处理的知识体系,希望能够帮助到你的课 ...

与常规的RNA-Seq一样,10x单细胞RNA-Seq/ST-Seq也需要测序数据比对到参考基因组进行基因的定量.那么参考基因组的质量就对单细胞的分析结果有着重大的影响. 接下来小编就给大家介绍一下1 ...

来源:光明网-<光明日报>2021-05-09 02:31 X 我科学家绘制出高精度亚洲猪参考基因组图谱有助于新品种培育改良光明日报北京5月8日电记者杨舒8日从中国农业科学院获悉,该 ...

参考基因组用错了单细胞转录组流程照样可以走通