空间转录组学：下一个组学前沿 / 四六文摘

# 背景介绍单细胞相关的研究数据常常以原始数据的形式存储,由于需要使用复杂的计算流程进行数据处理,生物研究人员很难访问这种格式的数据.虽然目前已经有一些数据库收集.管理和整合scRNA-seq数据和 ...

空间转录组学技术自斩获了 Nature Methods 2020 年 "年度技术" 以来,引起更加广泛的关注.这种技术结合了成像和测序技术,能够绘制组织上特定转录物存在的位置,从而 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读空间分辨转录组学的最新进展极大地扩展了复杂的多细胞生物系统的知识.近年来,该领域迅速扩展,并且已经开发了几种旨在将基因表达数据与空间信 ...

2021 年 1 月,Nature 将空间转录组学评为 2020 年 "年度技术",业内很多人士都认为,空间转录组学是解读基因表达的下一个前沿技术. 波士顿儿童医院的助理教授 Je ...

浩瀚星空吸引着人们进行探索.在转录组学中,空间分辨率也开辟了新的世界. 导读空间转录组学是单细胞分析后的下一波热潮,这是一个非常活跃的领域,新的技术开辟了新的科研角度.该技术不仅可以获取转录组数据并 ...

关于基因检测或者说基因测序,还是不要说基因检测,最好和市面上那些消费级基因检测拉开些距离,这行的名声都快被消费级的检测毁了,我一下说的都是医疗级的测序,包括婴幼儿的遗传病筛查.肿瘤的测序和以天赋检测等 ...

2016年,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所.瑞典皇家理工学院等研究机构的学者们在<Science>上发文,阐述了一种新的转录组学研究技术,并提出了"空间转录组学"的概念.虽然 ...

人类社会每一次关键的发展都有赖于科学的进步.诺贝尔奖获得者悉尼·布伦纳曾称,科学的进步依赖于新技术.新发现和新想法,新技术优于新发现,新发现优于新想法.在生命科学领域,新技术和新工具的应用同样意义非凡 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 前言记得我们在ST Pipeline||空间转录 ...

文献来源 Kharchenko, Peter V. The triumphs, and limitations of computational methods for scRNA-seq. Natu ...

"当你在观察一种免疫反应的时候,这些免疫细胞到底是在攻击肿瘤细胞,还是在攻击感染了冠状病毒的细胞?这个问题可以通过空间技术找到答案,这是以前的技术所无法实现的." 空间生物学公司 ...

拿真核转录组测序为例,实验流程分为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序:项目分析流程分为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析和SNP分析-基因功能注释-基 ...

将基因的表达与组织切片的免疫组化图像进行整合,从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去,从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达,达到直观检测组织中不同部位基因表达的 ...

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

空间转录组学：下一个组学前沿