基于gff3/gtf文件-批量提取启动子或CDS序列-任何人都可以 / 四六文摘

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

▼分类: 生物信息学1:软件网址:https://ccb.jhu.edu/software/glimmerhmm/2:下载近源物种的gff文件以及基因组序列,这个近源物种的寻找,个人的方法就是搞清楚你 ...

与常规的RNA-Seq一样,10x单细胞RNA-Seq/ST-Seq也需要测序数据比对到参考基因组进行基因的定量.那么参考基因组的质量就对单细胞的分析结果有着重大的影响. 接下来小编就给大家介绍一下1 ...

[软件介绍]IGV软件的安装和基本介绍 - 目录 1. IGV 下载与安装 2. Java 安装及环境变量设置 3. IGV 基本介绍 3.1 IGV 界面布局 3.2 IGV 结果界面 3.3 序列 ...

gffread gffread: used to generate a FASTA file with the DNA sequences for all transcripts in a GFF f ...

写在前面大概一年前就有不少朋友提到想了解相关功能的操作.尽管在公众号上已推送过几乎每一个功能的推送,但文字吸收效率可能确实不如视频讲演.一年前挖的坑,现在终于可以填了.直接原因还是最近数据分析时优化 ...

需求客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt image.png test.vcf image.png 代码实现 ...

想要实现批量提取文件名这个功能去请教别人,vbs高手说写一个程序就行了;excel高手说编一个函数或者宏定义就OK.拜托,我只是要提取文件名而已,函数编程现学来不及,难道真的只能复制粘贴?不用怕,很简 ...

!!!!,注意上图是**顺式作用元件在启动子上的批量可视化,当然最后坐标要自己调,直接全部-2000bp,5' 和 3' 替换 ** 写在前面以前总看到问题是,基因结构可视化的问题:现在则变成了启动 ...

无论是Windows,MacOS, Linux桌面的用户,你都可以也会使用. 写在前面伴随基因组测序的普及,越来越多物种的基因组测序项目开展并报道,为科研工作者提供了更为全面的参考序列信息.目前,单 ...

word批量处理多文档到Excel(备用) 从多个Word文件中提取指定的值到Excel中,支持表格嵌套.如果使用上一个菜单"多文档到Excel"无法达到您的需求,可用本工具试试 ...

word批量处理多文档到Excel 从多个Word文件中提取指定的值到Excel中,也可以理解为把多个Word文件的值放在一个表格中,便于统计或查阅.

上次分享了<怎样批量提取文件夹下文件名>,介绍了文件夹下批量提取文件处理方法,子文夹下面文件无法提取,使用很不方便,下面分享包含子文件所有文件提取处理方法. 工具/原料 Microsoft ...

电脑操作时,经常要用到电脑文件夹下文件名,常规方法是在文件夹下选文件名重命名,复制文件名,在相应录入软件粘贴文件名.如果要用到成百上千个文件名,按这种方法那多费时费力,同时也无法复制文件后缀名.那下面 ...

基于gff3/gtf文件-批量提取启动子或CDS序列-任何人都可以