[数据库介绍]g:profiler 多ID富集分析 / 四六文摘

寻找差异表达的基因并识别它们的功能,是我们进行RNA测序的最主要目的.很明显,这些差异的基因必然与功能改变密切相关,例如,比较患病个体与正常个体的组织表达谱,不难想到这些显著失调的基因参与了生物学过程 ...

据不完全统计,今年来基迪奥OmicShare云工具平台的KEGG和GO富集分析工具使用次数已经突破30,000+啦!KEGG和GO富集分析作为平台使用频率最高的工具之一,一直陪伴大家.听许多对生信还不 ...

功能富集分析你还在使用clusterProfiler R包进行编程绘图吗?今天要和大家介绍一款强大的基因功能富集分析的在线工具--Metascape,由诺华研究基金会基因组研究所(GNF)的一组研究人 ...

昨天我们介绍了富集分析的基本的内容:GO分析和KEGG分析都是啥?.但是富集分析还是有很多不同的算法的,对于主要的算法过程其实不用太多了解,这个由专业人士来解决就行.但是对于其输入条件和主要区别还是要 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

TCGA数据库是一个包括33种癌的各个组学的数据库.我们通过TCGA数据库可以观察每个人的基因表达的变化:甲基化的变化:拷贝数的变化:以及他们的临床信息.MEXPRESS(https://mexpre ...

相信很多人都知道用DAVID做GO富集分析总是被吐槽,数据更新实在是太慢了,太慢了,但是很多人又不想用R包和Cytoscape来做,因为很多时候安装包太麻烦了,还是觉得在线分析比较好.下面我们就推荐两 ...

这部分开始进行基本的富集分析,两类 A:差异基因富集分析(不需要表达值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有无差异,需要全部genes表达值) ######## ...

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时间:2019-01-29 来源:中国生物化学与分子生物学报作者:陈伟,吴仙华,孙绍光本文字数:12111字摘要: 环状RNA (circular RNA, circRNA) 是由真核生 ...

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