【PANDA姐的转录组入门】拟南芥实战项目-定量、差异表达、功能分析

相关推荐

• seqkit：序列梳理神器-统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等30项全能

  写在前面 通过我几天的学习,我发现,seqkit十分好用,将序列的各种操作都囊括进去,加入多线程,我个人认为这将是非常好的胶水,在处理无论是基因组还是其他组学.定是一个必学神器.注意一下教程在0.15 ...

• MPB：微生物所蔡磊组-​​基于二代测序的真菌基因组组装和注释

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• 科研 | NC：单细胞转录组研究拟南芥早期胚胎发育过程细胞的“命运”（国人佳作）

  编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在拟南芥中,受精卵经历不对称的细胞分裂形成了原胚的两种不同的细胞类型,顶端细胞和基底细胞.调控顶端细胞(AC)和基底细胞(BC)发育 ...

• 科研│PLANT J: 全球转录组分析揭示了拟南芥剪接事件的昼夜节律控制

  编译:微科盟 Nicole,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 拟南芥的昼夜节律控制着许多生理和分子过程,使植物能够预测其环境的每日变化.然而,mRNA水平变化如何与共转录/转 ...

• 科研 | PLANT PHYSIOL：两种拟南芥生态型对磷酸盐饥饿的非编码转录组响应

  编译:晨晨,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 植物基因组编码区有很强的保护,不同植物物种的根的结构差异很大,相同物种不同的生态型之间也存在差异.不同生态型植株的非编码RNA进化迅速 ...

• 科研 | 山西农业大学：生理，代谢和转录组分析揭示了拟南芥幼苗对碳纳米角的响应（国人佳作）

  编译:Mr. Left,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 碳基纳米材料在纳米农业中具有潜在的应用.但是,单壁碳纳米角(SWCNH)介导的植物生长的生理和分子机制仍不清楚.本研究中作 ...

• 科研 | The Plant Cell：RNA代谢标记揭示了拟南芥转录组的隐藏特征和动态变化

  编译:秦时明月,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 基于RNA测序(RNA-seq)的转录组分析已成为现代植物生物学中不可缺少的研究工具.几乎所有的RNA-seq研究都提供了稳态转录 ...

• 科研 | Cell Reports：高光胁迫下拟南芥转录组的特异性和动态反应研究（国人佳作）

  编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 光照是自然中变化最快的因素,同时对植物来说也是最重要的.当植物暴露在高光环境下时,会发生非光化学能猝灭,以热量的形式消散过量的能量,从而 ...

• 拟南芥（Arabidopsis thaliana）遗传转化实验技术原理

  拟南芥是植物领域应用较为广泛的模式生物.由于具有较小的基因组(135 Mbp),生命周期短,可以在多种环境下生长,一直被视为研究植物遗传学.进化.种群遗传学和植物生长发育的系统. 农杆菌介导的蘸花法是 ...

• 茶树中组蛋白H3K4甲基转移酶CsSDG36的异位表达会降低拟南芥的高渗胁迫耐受性

  组蛋白甲基化在许多植物的干旱反应中起着重要的调节作用,但其在茶树干旱反应中的调节机制仍知之甚少.在这里,干旱胁迫被证明可以降低茶树的相对含水量并显着下调组蛋白H3K4的甲基化. 根据我们之前对SDG基 ...

• PaperRSS文献速递|拟南芥胚胎发生过程中边界表达基因EPFL2编码信号肽的促进子叶生长

  茎端器官边界边界在植物生长和形态建成中起着重要作用.据报道,一个编码富含半胱氨酸的 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE (EPFL)家族分泌肽的基因,EPFL2,在拟南芥 ...