TCGA数据挖掘网站-UALCAN / 四六文摘

自从meta分析贬值了之后,生信数据挖掘成为了国内医生.研究生.博士.教师火爆的发文神器,可是令人头痛的事情来了,生信往往需要学习编程,其中R就必不可少,如果要挖TCGA.SEER,Perl或者Pyt ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. 2020年3月美国马里兰州巴尔的约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...

Enhanced B7-H4 expression in gliomas with low PD-L1 expression identifies super-cold tumors在PD-L1低表达 ...

随着高通量测序技术的迅猛发展,各种生物医学数据库应运而生,大数据挖掘技术已成为生物医学领域中最新最重要驱动力之一.GEO是当今最大.最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达.突变.修饰等信息,涵盖几乎 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

今天介绍一种实验为主,TCGA数据挖掘为辅的6分+发文方法.这篇文章发表在Cell Death & Disease上,影响因子:6.3,中科院最新分区:二区,属于OA期刊,需要收取版面费,不在 ...

有人会说纯生信SCI是"垃圾论文",一直忽略它的研究意义,大多数做纯生信数据挖掘的人都是没有钱做验证的,故没有办法证明某一分子是否促进/抑制肿瘤发生发展,更没有办法探索其具体作用机 ...

文章题目:miR-378a-5p inhibits the proliferation of colorectal cancer cells by downregulating CDK1 研究背景: ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

下载样本信息首先从UCSC Xena数据库下载样本信息 UCSC Xena网址:https://xena.ucsc.edu/public-hubs/ 根据上图的链接可以下载到样本信息,文件为 &qu ...

生信技能树有话说:最近刚刚组建一个TCGA交流群:4年前的TCGA重磅资料你学了吗把资料系统性整理给到了大家,发现其中一个群友聊天非常积极,而且看得到的进步,就要求他投稿,原题目是: R菜鸟及生信菜 ...

我们生信技能树和京东联合起来做了一个超级大促销,见: 什么,生信入门全套书籍仅需160,这4本书籍,单独的每一个都在100元价位,但是4个合起来,反而只需要161,相当于每本书才40元人民币,5美元左 ...

研究背景: 前胶原赖氨酰羟化酶1(PLOD1)在恶性肿瘤中高表达,例如食道鳞状细胞癌,胃癌和大肠癌.生物信息学分析显示PLOD1与GBM的进展有关,尤其是最恶性的间充质亚型(MES).此外,在TCGA ...

这篇文章跟之前的分享文章有着非常大的差别,之前分享的文章基本上很多零基础的朋友通过短时间的学习都能够作出来,但是这篇文章不一样,即使有钱有时间都很难搞出来,不信你可以试试.文章题目:Character ...

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