TCGA数据分析总结（截止2020.4.21） / 四六文摘

有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA 数据库的用法,正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧. 有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA ...

目前做数据挖掘的人越来越多了,感觉TCGA的数据不够用了,自己想写的癌症种类都别人写了,感觉没有什么希望了,其实并不是的.例如有人利用TCGA的mRNA做了差异分析,GO,KEGG分析,PPI分析,生 ...

写在前面关于TCGA的数据分析.之前我们推荐过的几个网站.其中GIPIA的话是只是可以分析基因表达的数据,而且在很多文章当中都可以用到.CbIo的在多组学的分析方面也能体现它的价值.今天就给大家再介 ...

最近写了一段代码,基于肿瘤TCGA数据库进行一系列分析.只要输入基因名,就可以得到以下结果(注意:只能是mRNA的gene symbol) 1 泛癌表达:该基因在33种肿瘤中的表达 2 差异表达:肿瘤 ...

文章题目:Identification of a novel gene expression signature associated with overall survival in patient ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

近年来,快速发展的二代测序技术为揭示复杂性状遗传基础以及表型变异的机制提供了重要工具.转录组技术不但可以检测细胞或组织中所有基因的表达,而且为鉴定转录本中的遗传变异提供了新的机会,为深入挖掘性状功能基 ...

常规的转录表达矩阵分析大家都应该是不陌生了,不管是芯片还是测序,最后都是表达矩阵走差异分析的流程.但这样仅仅是定位到基因集,生物学功能通路等等,如果讲一个完整的生物学故事有点单薄.以前我写过教程:基因 ...

随着高通量测序技术种类的越来越多,我们经常会拿到相关样本的不同组学的数据.那拿 TCGA 的数据库而言,对于同一个患者,就检测了RNA-seq, miRNA-seq, 甲基化芯片等等多组学的数据.对于 ...

原作者:世界美景 01 西藏最虔诚的信仰「西藏是一种病,不去永远治不好.」沿着G318去西藏,走过这条朝圣之路,不只为风景的壮阔绝美,还为心底最初的梦想,无数次默念的远方. 去看圣洁俊毅的雪山,纯 ...

本帖最后由 aleko712 于 2020-11-21 21:22 编辑文化力量此 Mod 更改并加强了动物园, 博物馆, 植物园的套装效果, 并且在游戏中做了翻译. 由于感觉游戏中对套装收集 ...

第一部分:高新技术企业年报填报要求和工作流程介绍政策依据: <高新技术企业认定管理办法>(国科发火[2016]32号) <高新技术企业认定管理工作指引>(国科发火[2016] ...

今日主评丨叶建英 1 近日中签率播报 2 正在公示(共计14个) ◆湖景居,金沙湖 ◇房源套数:77套 ◇均价:35950元/㎡(带精装) ◇房源面积:50-60㎡ ◇参摇门槛:待定 ◇摇号登记时间: ...

| 越来越多的流摇盘摇起来了今日主评丨叶建英限价政策下面,楼盘比本领比利润,比的不是售价,而是速度.因为只要品质基本靠谱,即使此前流摇的盘,往往也能以时间换空间,最终摇起来.真可谓,曾经的爱理不理 ...

| 无房户越来越多了今日主评丨叶建英第一批六个热点楼盘的最终登记人数出来了. 图片来源:杭州楼市动态预料中的结果是,热盘分流,而且因为加了五年限售的紧箍咒,投资者占比减少,自住无房户的占比相应提 ...

今日主评丨叶建英 1 近日中签率播报 2 正在登记(共计5个) ◆新希望华发·锦粼云荟,萧山市北 ◇房源套数:342套 ◇均价:高层32500元/㎡,洋房34000元/㎡(含装修标准3500元/㎡) ...

| 不是每一个边套98方,都是超级户型. 今日主评丨叶建英 1 21日中签率播报区域楼盘名称无房中签率有房中签率萧山区招商·闻博花城 95.11% 43.75% 2 正在登记(共计13个) ...

2021年5月19日,(杜尚别,夏冉译)据"霍瓦尔"的消息称,塔吉克斯坦国家投资和财产管理委员会表示,到2020年底,中国对塔吉克斯坦经济的投资额将达到30亿1500万美元. 20 ...

TCGA数据分析总结（截止2020.4.21）