这大概就是Six god合体吧! 草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络:SymMap

由于中医的特殊性,医师在治疗时经常多味中药联合使用来发挥最大药效。但由于中药多成分、多靶点的特性,想弄清药品在其中的作用机制是较难的。但随着中医网络药理学的发展,这个难题也被一个数据库逐渐解决--SymMap数据库。

SymMap是一个中医药证候关联数据库,里面包含了499种在中国药典中注册的草药,19,595种成分,以及1,717种中医使用的相应症状(TCM症状),将中医症状精确连接到现代医学中使用的961个症状术语(MM症状)。此外,SymMap通过症状-疾病关联或成分-靶标关系收集了这些草药的相关靶标(基因)和疾病,总共包含了4,302个靶点和5,235个疾病。所以SymMap可提供大量有关草药,中医症状,MM症状(现代医学中使用的症状),成分,目标和疾病的描述性信息。它还通过直接关联或间接统计推断在所有这六种类型的组件之间提供成对关系:草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络。

SymMap

https://www.symmap.org/

这个数据库的界面非常简洁,提供了浏览和搜索的选项,同时首页六种类型的组件图例也说明了,使用这个数据库的时候,可以从这六个方面进行入手。

一、浏览SymMap

我们可以通过单击主页上的“search”按钮来浏览数据库,然后通过在浏览页面的下拉菜单中进行选择来访问特定数据。

单击了特定成分,例如中医症状(中医症状),就会显示有关所有中医症状的摘要表,有草药编号、中文名拼音、拉丁名、英文名、中文班、英语课。可以在下载页面的文件格式部分中的每个浏览表中获得列名的说明。通常表中显示的第一列是每个特定术语的SymMap ID,其中包含指向其详细说明页面的超链接。

二、在SymMap中搜索

要在SymMap中进行搜索,用户可以首先单击主页上的“搜索”按钮,然后在搜索页面中输入并搜索感兴趣的查询词。

SymMap中包含的每个组件分别提供六个不同的搜索框。并且对于每个搜索框,搜索项都进行了不同的设置。当用户搜索特定的MM症状(现代医学中使用的症状)时,允许使用三种类型的项目。

第一种是MM症状名称,例如发烧。

第二种类型是广泛接受的数据库UMLS中MM症状的外部ID。

第三类包括多个别名,这些别名是从多个数据库中收集的,以方便用户使用,例如发热或体温升高。

所有类型的允许搜索项目都直接显示在搜索框后面。这些搜索项的说明在下载页面的文件格式部分中显示。通过在SymMap中执行的自动完成搜索功能输入部分查询项,即可选择可能的匹配项。

以青蒿为例,搜索之后,输入查询词的可能匹配项显示在搜索页面的下部:

第一列为SymMap ID,单击SymMap ID上的超链接可以获取详细信息,结果分为三部分:

Part 1 草药摘要

摘要面板显示搜索项的描述性信息,所有这些信息包括五种类型。第一种类型是herb_id。第二种是草药名称,用中文,拼音,拉丁或英语表示。第三种是中医术语的描述,例如属性和功能。第四类是像青蒿药材的中文或英文分类,以及用于药物的部分(使用部分)。最后一种类型是在其他有关TCM的数据库里中药的ID,例如TCMID,TCM-ID和TCMSP。

Part 2 SymMap网络

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