如果只会利用TCGA数据构建cox回归，你就out了 / 四六文摘

Identification of a Sixteen-gene Prognostic Biomarker for Lung Adenocarcinoma Using a Machine Learni ...

glmnet提供了LASSO或ridge regression的Cox-PH分析模式,用于研究预测变量与生存时间的关系. 加载数据 library(glmnet)library(survival)da ...

一.列线图介绍列线图也称为诺莫图,英文Nomogram,本质上是一种用于求解方程的图形计算装置.使用者可以忽略方程式中各变量的复杂关系,单根据已知的变量值去画线就可以快速解出剩下的那个未知变量的大小. ...

很久以前我们提到过TCGA的各种网页数据库的生存分析结果冲突的问题 TCGA数据库生存分析的网页工具哪家强现在又有人提出来一个新的问题,如下: 根据基因表达量的中位值把样本分成高低表达量的组别, ...

Computational Detection of Breast Cancer Invasiveness with DNA Methylation Biomarkers用DNA甲基化生物标志计算检测 ...

Six-gene signature for predicting survival in patients with head and neck squamous cell carcinoma 6- ...

大家好,今天和大家分享的是2020年1月发表在"Frontiers in Genetics" (IF=3.258)上的一篇文章"An Integrated Model B ...

这篇文章题目:A prognostic 3‐long noncoding RNA signature for patients with gastric cancer 文章链接:https://www ...

有的人利用TCGA数据发了1-2分的SCI:有的人利用TCGA数据发了3-5分的SCI:现在有人利用TCGA数据发了12的SCI.这篇文章发表在Nat Commun上,该期刊属于Nature子刊,影响 ...

曾记否,咱们一起讨论过calibration curve,也就是校准曲线,校准曲线其实是实际发生率和预测发生率的散点图.还记得logistic回归的calibration curve怎么做吗?链接在此 ...

测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miR ...

今天是各类统计方法R语言实现的第14期,我们主要介绍Cox回归分析. Cox回归分析之前讲到生存分析可以通过K-M生存曲线.logrank检验以及的Cox回归分析实现,其中K-M生存曲线.logra ...

在搜索TCGA数据库文章,有非常多的文章喜欢利用TCGA lncRNA发文章,也就是构建模型,大概就是下面的流程; 1.下载TCGA lncRNA 2.进行差异分析 3.单因素初步筛选lncRNA 4 ...

只需几个温度探头和秒表,就可以在咖啡烘焙过程中收集大量数据,特别是使用能够实时执行高级计算的烘焙程序的情况下. 这些数据可以帮助您开发一致的.可控的和高质量的咖啡烘焙流程.但如果没有对您收集的数字的正 ...

几十上百页的财报,看起来不仅费时费力,还很难抓住重点. 今天给大家提炼9个关键指标.只要看懂这9个数据,就能轻松搞清楚公司的真实投资价值,建议大家认真看完. 首先,一家公司是否值得投资,我们一般从四个 ...

如果只会利用TCGA数据构建cox回归，你就out了