科研 | 在单细胞分辨率下了解人类肠道疾病 / 四六文摘

单细胞转录组技术为探索疾病微环境中的细胞亚群提供了新思路,有利于研究疾病的发生.发展.耐药性和免疫逃逸.然而,目前缺乏在细胞水平上系统的.分层的和庞大的人类疾病基因表达谱数据库. 来自西北工业大学.西 ...

# 背景介绍单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术是以单个细胞分辨率研究复杂生物的转录组,这种形式能够为科学家研究细胞在表达模式上的异质性,特别是疾病细胞的异质性.scRNA-seq的快速发展为 ...

目前已有的单细胞数据库中,SCDevDB专注的是人不同发育通路的单细胞基因表达谱,JingleBells提供有关免疫相关数据集的scRNA-seq BAM文件,SCPortalen集成了单细胞宏数据, ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 芽尖祖细胞可产生所有小鼠肺上皮细胞系,并已在发育中的人类肺中进行了研究.但是,控制人类芽尖分化为特定细胞谱系的机制尚不清楚.本研究使用人类芽 ...

编译:微科盟骆芷寒,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本研究结合单细胞RNA测序与空间转录组学来表述随时间变化的肠道形态.首先鉴定了101个细胞群,包括上皮和间质细胞群以及 ...

编译:微科盟 Champion,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人类肠道干细胞的生态位支持自我更新和上皮功能,但对其发育情况知之甚少.本研究使用单细胞mRNA测序和原位验证 ...

编译:萌依依,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物在茎尖分生组织(SAM)中存在维持着多能干细胞的群体,这些干细胞不断地产生新的地上器官.本研究使用单细胞RNA测序(scRNA- ...

编译:怀瑾,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读皮肤响应牵张的能力已经被充分用于重建手术.在塑造组织结构的过程中,细胞会受到机械力的作用,由细胞骨架.细胞间粘附力以及细胞外基质(E ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 肿瘤环境由多种类型细胞及其不同的环境构成,在本研究中研究人员开发了一种计算通道来研究单细胞的代谢程序.在两种人类代表性的肿瘤(恶性黑素瘤和头 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读原肠胚三个初始胚层的形成是建立脊椎动物身体发育必不可少的步骤,并且与主要的转录变化相关.这些变化伴随着表观遗传重编程,但是表观基因组在 ...

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组分析使在发育.健康和疾病期间对组织中的细胞群进行高分辨率分析成为可能.最近的研究创新性地利用单细胞RNA测序(scRNAs ...

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