表达量何须以基因为单位 / 四六文摘

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读骨髓是血液生成和骨骼再生的主要部位.但是,其细胞和空间组织定位仍存在争议.本研究结合单细胞和空间转录组学系统地揭示了不同骨髓生态位的分 ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

编译:杨峰,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读心肌肥厚有时会作为对压力超负荷.容积超负荷或梗死后重塑引起的左心室(LV)壁应力增加的代偿反应出现.然而,在长期的疾病应激诱导的心肌 ...

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics 联合单细胞转录组 ...

太多人咨询基因的各种ID转换问题,在非模式生物的物种里面更麻烦,因为数据库注释资源并不权威. 但是实际上这样的基因ID转换也不是必须的,因为差异分析要的是表达量矩阵,基因名字并不重要啊,后面的注释也是 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

m长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的 ...

不一定是转录水平的表达量. 看到一篇文章提到了这个DESI-MSI分析,可以说目前主流的研究都会引入表达芯片或者mRNA-seq测序来看敲减目标基因或者过表达基因后的效果,但是该文章探索的主要是蛋白质 ...

这个需求实在是太常见了,很多时候我们下载的表达矩阵,都是基因的探针ID作为行名来标记,如下: 这个变量是 dat,一个表达矩阵, 所以需要对探针进行注释,并且筛选. 首先看看注释的结果: 很明显可以看 ...

不知道多少人看完了全网第一个单细胞课程(免费基础课程),免费学习地址在B站:https://www.bilibili.com/video/av38741055 而且完成结业考核20题:https:/ ...

看到一个比较古老的生物学领域的研究文献,文章标题是:<Analysis of CUL-5 expression in breast epithelial cells, breast cancer ...

2 序言第四单元第一讲:计算基因在任意癌症表达量相关性课程链接在:http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53 从题目可以看到,这 ...

课程笔记粉丝:有单细胞线上课程吗? 小编:什么 ? 我们的单细胞转录组分析线上课程已经上线好久了,你们竟然都不知道吗,每篇推文后面的课程推荐没人看的吗,小编已哭晕在厕所好了,戏演完了,下面郑重介绍 ...

表达量何须以基因为单位