使用monocle做拟时序分析（单细胞谱系发育） / 四六文摘

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读了解β细胞生成和再生的背后机制是治疗糖尿病的关键.然而,传统的基于细胞群的研究方法在定义β细胞分化和反分化过程及相关的调节机制方面存在 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读气孔谱系细胞发育的调控已被广泛研究.然而,基于单细胞转录组研究这一生物学过程还尚未报道.本文,作者主要对拟南芥5日龄的12844个单 ...

编译:刘娟,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读巨噬细胞是胚胎发育过程中出现的新生免疫系统中最早的细胞.在小鼠身上,胚胎巨噬细胞浸润正在发育的器官并在这些器官内向组织驻留巨噬细胞( ...

编译:怀瑾,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读癌症干细胞对于癌症的发生.发展和耐药性至关重要,但目前对于这些过程及其与胶质母细胞瘤异质性相关性的理解有限.因此,本研究对成年胶质母 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读详细研究人类原肠前胚胎发育(包括空间自发组装和细胞类型个体发育)仍然受到现有二维(2D)平台的限制,这些平台无法模拟体内条件.在这里, ...

刚出生的新生儿最需要的唯一食物就是母乳. 但在养育新生儿的时候,很多家长都会进入一个盲区,到底该不该给孩子喂水?有人认为该给孩子喂水,因为水是我们人体最需要的物质,让孩子喝水才能帮助孩子创造良好的肠胃 ...

编译:Yong-qin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物根系结构和侧根的密度与分支程度有关.侧根的发育始于中柱鞘细胞且受生长素调控,生长素信号由ARF7/19蛋白调控(IAA ...

植物地上部分来源于茎尖分生组织(SAM)中的多能细胞.这种干细胞群体通过一个涉及WUSCHEL (WUS)和CLAVATA3稳定表达的负反馈回路来维持. SAM的大小是动态的,在过渡到生殖生长时经历超 ...

拟对象的谱系学:数字对象理论的序曲内容摘要:如何思考对象问题一直是哲学领域的核心问题.从启蒙早期开始,人们已经基于自然和社会的二分来思考对象,而这种二分体制下的对象实际上导致了某种特殊的" ...

最近刷了刷植物领域单细胞文献,有一个蛮早期的拟南芥根部单细胞研究:<High-Throughput Single-Cell Transcriptome Profiling of Plant Ce ...

昨天我在单细胞天地讲解了使用monocle2进行拟时序分析的方法,基本上跟着我的代码走一波就可以学会了,当然具体参数理解需要自行发力哦,见:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育) 用法只是最 ...

前面我们已经介绍了:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育) 然后回答了一个学员的问题: 拟时序分析的热图提取基因问题 , 但是因为大家对monocle包的说明书不熟悉,对R不熟练,以至于无 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

使用monocle做拟时序分析（单细胞谱系发育）