R语言GEO数据处理（六）

赞 (0)

相关推荐

  • Cadence 建立 最简单的器件Library ---Symbol

    今天从基础开始学习Cadence,建议一个简单的器件symbol. 选择这个LDO ,SGM2036 ,从规格书中找到典型应用电路: 点击File ,选择New中的library. 完成如下一个sym ...

  • Probe id 如何转换为gene symbol?

    之前有很多人问我们,有时候没有DataSet full SOFT file文件,只有图二的界面,该怎么办呢? 我们可以下载Series Matrix File(s),然后进行分析 但是这样得到的仅有p ...

  • R语言GEO数据处理（一）

    # 1. GEO数据下载 ----------------------------------------------------------------- rm(list=ls())   #清空环境 ...

  • R语言GEO数据处理（二）

    #1. GEO数据的下载 ##1.1 方法一:下载RAW Data数据 ##1.2 方法二:下载series Matrix表达数据 rt <- read.table("GSE56814 ...

  • R语言GEO数据处理（三）

    # 2. 提取表达和临床信息 --------------------------------------------------------------- ##2.1 通过pData函数获取分组信息 ...

  • R语言GEO数据处理（四）

    # 3. id转换 ----------------------------------------------------------------- ##方法一:使用R包转换 index = gse ...

  • R语言GEO数据处理（五）

    # 4. PCA分析 ---------------------------------------------------------------- library(FactoMineR) libr ...

  • R语言GEO数据处理（七）

    # 6. 可视化展示 ---------------------------------------------------------------- ##6.1 火山图 library(ggplot ...

  • 各类统计方法R语言实现（六）

    今天是各类统计方法R语言实现的第六期,我们主要介绍多元线性回归.回归诊断. 多元线性回归 多元线性回归指的是用多个自变量预测一个因变量,且自变量与因变量之间为线性关系,在分析过程中要考虑交互项的问题. ...

  • R语言GEO数据挖掘-功能富集分析

    欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 功能富集分析   在得到了差异基因的基础之上,进一步进行功能富集分析,这里 ...

  • R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵

    欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据,提取表达矩阵,提取m ...