SPATA：基因集驱动的空间转录组分析框架

相关推荐

• Fgf21基因敲除小鼠模型构建技术原理

  Fgf21基因敲除小鼠背景信息 FGF家族成员具有广泛的促有丝分裂和细胞存活特性,并参与多种生物过程,包括胚胎发育.细胞生长.形态发生.组织修复.肿瘤生长和侵袭. 成纤维细胞生长因子21(FGF21) ...

• 小鼠大脑之空间转录组分析

  男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 正文 这是ST团队进行的一个示例实验.在一个单独的 ...

• 基因表达实现“3D”可视化，空间转录组学将是单细胞分析之后的又一波热潮

  空间转录组学技术自斩获了 Nature Methods 2020 年 "年度技术" 以来,引起更加广泛的关注.这种技术结合了成像和测序技术,能够绘制组织上特定转录物存在的位置,从而 ...

• 科研│中国林业科学研究院：核桃胚胎的转录组分析揭示了脂类生物合成和多不饱和脂肪酸代谢的关键发育阶段和相关基因（国人佳作）

  编译:微科盟伊一,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 核桃是一种广泛栽培的木本油料树种,其胚富含多不饱和脂肪酸.迄今为止,核桃胚胎发育过程中油脂生物合成的途径和必需基因仍不清楚 ...

• 科研│BIOTECHNOL BIOFUELS：比较转录组分析两种不同生长速率的杨树基因型之间的基因和基因模块差异（国人佳作）

  编译:伊一,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 背景:木材为全球生物燃料生产提供了重要的生物质资源.树干的径向生长对于林业和生物燃料的生物量生产至关重要,但从基因上剖析是有挑战性的, ...

• 科研 | SCI TOTAL ENVIRON：酪丁酸梭菌过表达吸氢酶基因的转录组分析（国人佳作）

  编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 酪丁酸梭菌(Clostridium Tyrobuyricum)是一种有前途的生产生物燃料的微生物.本研究发现酪丁酸梭菌中过表达吸氢酶 ...

• 科研 |Gene：PGC-1α结合RNA全转录组分析确定与胰高血糖素代谢作用相关的基因

  编译:不二,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 过氧化物酶体增殖物激活受体γ-共激活因子1-α(PGC-1α)是一种转录共激活因子,它控制代谢/能量基因的表达,控制细胞对营养和环境适 ...

• 科研 | BMC Plant Biol.：低温胁迫下水稻萌发种子的转录组分析及耐冷基因LTG5的鉴定

  编译:秦时明月,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 低温是水稻产量和地理分布的限制因素.野生稻是水稻改良的重要种质资源,它对许多非生物胁迫具有良好的耐受性,包括低温胁迫,但人们对其 ...

• 科研 | 南京农业大学：通过分布调查、植物化学和转录组分析鉴定参与两面针功能成分生物合成的候选基因（国人作品）

  编译:Sophie,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 两面针(Zanthoxylum nitidum (Roxb.) DC)的干燥根在中医药治疗类风湿关节炎.牙痛.胃痛.瘀伤.蛇咬 ...

• 科研 | 河南农业大学：西瓜黄皮形成的转录组分析及性状基因的染色体定位（国人作品）

  编译:Yong-qin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 西瓜(Citrullus lanatus)二倍体含22条染色体,基因组~425Mb.叶绿素和类胡萝卜素是影响西瓜着色的主要 ...