茶尺蠖的染色体级别基因组 / 四六文摘

从组装好的基因组序列到基因注释这一步,说简单也简单,说难也难.这里的难是指,在转录水平上做到95%以上的准确率,还是比较困难的.我们前面曾经介绍过基因注释的一些内容. 基因注释一般是指采用生物信息学的 ...

种内变异是物种进化成功的基石.从遥远的来源获得遗传物质是细菌的一种重要适应机制,但在真核生物中也可以发挥作用. 本文研究了大麦属(Pooideae)种核基因组中圆锥花序(禾本科,圆锥花序科)起源染色体 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

搞生信研究的,大部分数据都是针对于人类的,那么人类的参考基因组就不得不知了! 与hg19的突变相关的一些数据解释. Hg19基因组的分析 R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UC ...

摘要两张图总结本文,以方便大家确定是否还有看下去的兴趣写在前面 Emmm... 今天开放一个旧功能,全基因组基因密度统计.虽然是早前就写好的,但我一直没开放,主要是考虑到这个功能感兴趣或者用得上的 ...

基因印记(Genomic imprinting)是一种重要的表观调控机制.通常情况下,人类这种二倍体基因组的两份等位基因都可以表达,但少数(小于1%)基因由于受到基因印记影响,其中一份基因失去作用.例 ...

在欧美国家,染色体基因组芯片分析(chromosome microarray analysis,CMA )目前已成为一项常规的临床遗传学诊断工具.继美国医学遗传学会(American College ...

推荐:江舜尧编译:杨雅媛编辑:马莉福建省水产研究所海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室黄种持团队于2019年7月20日在<Moclecular Ecology Resources>发 ...

昨天,我们了解了一下SAM格式的比对结果,不知道大家理解的怎么样.但是全基因组测序数据实在是太大了,即使比对后把sam文件压缩成二进制的bam文件也还有55G(如何压缩转换可查看直播十二),如果完整的 ...

这类情况仅仅针对于双端测序数据,因为根据实验原理来看,对一个DNA片段,会把它的左右两端分别测序,但是测序仪器的测序长度有限,对本次实验来说,打断的DNA片段长度在350个碱基左右(这个长度只是一个分 ...

我们在第19讲留下了一个悬念:为什么我算的染色体覆盖度与公司给我的报告不符合!! 公司算出每条染色体的覆盖度都接近于100%了,而我是结果是: 很明显,chrY覆盖度严重偏低,21,22染色体也略堪忧 ...

在上一次直播中,我们说到了一个不符合我们的认知的问题.就是我的全基因组测序数据里找到的SNV的纯合杂合比例失衡,这着实让我非常纠结.在朋友圈大量求助中,肿瘤所的朋友非常热心的帮我检查了她手头的几百个外 ...

前面我们已经详细讲解过如何根据窗口来统计每条染色体的每个片段的GC含量,还有平均测序深度,请大家自行前往前面查看脚本及实现方式![直播]我的基因组47:测序深度和GC含量的关系那么如果得到了如下的数 ...

很久以前,我其实就遇到过通过NGS测序数据来判定性别的难题(搜索我博客即可查看详情),本次探究自己的基因组得到的统计结果与常识不符,所以我可以肯定是我们的常识太浅显了. [直播]我的基因组48:我可能 ...

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