理解RNA-seq表达矩阵的两个形式 / 四六文摘

一.单细胞single cell RNA-seq简介 1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq) Measures the average expression level for each ...

各位医学方的朋友,大家好.我是Flyman! 做过下游分析的小伙伴都知道富集分析的重要性,生信类文章大家总会在最后一步针对我们前面筛选出来的差异基因做一下GO/KEGG富集分析,研究一下他们参与到什么 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

Formation of volatiles in response to tea green leafhopper (Empoasca onukii Matsuda) herbivory in te ...

如果我们最后拿到的是蛋白编码基因,当然可以很容易的注释到各种数据库,比如:Gene Ontology terms, KEGG, Reactome, NetPath, PID, INOH and Bio ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了!(视频观看方式见文末) 下面是<GEO数据挖掘课程>的配套笔记(第二篇) 了解数据挖掘公共数据库:(数据来源) GEO和TCG ...

总是有粉丝询问多个分组的两两之间差异分析如何弄这样的问题,其实"师傅领进门,修行在个人",我们讲解了方法并且给予的全部的学习资源,理论上后续应该是大家各凭本事,做好自己的科研. l ...

正文文章的第一次分群按照 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), stromal (CD10+,MME,fibo or C ...

随着离开校园生活,本以为"语文"这门课也离我们远去了,但事实上语文从未走远,一直存在于我们的日常生活中,最常见的四种"语文"行为:听.说.读.写,在<吴军 ...

英语·实用口语本文属于英语口语原创 double 一模一样的人 double [ˈdʌbl] 一模一样的人作名词时,double 可以表示一模一样的人,your double 也就是你的翻版,可 ...

貌代码被折叠了,大家需要阅读原文才能复制粘贴我代码在Rstudio里面直接运行,几分钟就可以学会15个图的制作! basic visualization for expression matrix j ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! SRA->FASTQ->BAM->COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每 ...

在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律,也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库,当然,我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析过它,欢迎大家自行搜索学习.总得来说,从 ...

理解RNA-seq表达矩阵的两个形式