如何使用TCGA数据分析肠道菌群 / 四六文摘

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 编译:微科盟小木,编辑:微科盟茗溪.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众号. 导读放疗 ...

一.导读最近,榆林产妇跳楼事件再一次将人们的视线拉向顺产和剖宫产的问题.在出生过程中,婴儿会接触到大量活菌.而如今,有大量实验表明菌群与多种疾病的发展有关.虽然已有证据证实胎龄和喂养等因素会影响早产 ...

今天要介绍的这篇章是我们中国人写的,发表在Med Sci Monit上,这篇文章主要是通过下载GEO和TCGA的数据,通过差异表达分析,GO富集分析.KEGG富集分析,PPI分析,COX回归分析,筛选 ...

Comprehensive RNA Sequencing in Adenoma-Cancer Transition Identified Predictive Biomarkers and Thera ...

在本项研究中,作者下载TCGA结直肠癌(CRC)数据作为训练集,GEO数据库(GSE40967,GSE12945,GSE17536,GSE17537)作为验证集.从分子特征数据库中选择上皮间质转化相关 ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

编译:草重木雪,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肠道菌群及其代谢物对人体健康和疾病起着至关重要的作用,如今高通量测序.质谱和其他组学分析平台的发展提高了我们获得大量数据以及 ...

随着科学家们对肠道微生物越来越关注,相关研究成为最近医学研究的热门之一,对于肠道菌群在健康中作用也有更多了解,发现肠道菌群异常对于糖尿病.炎症性肠病.动脉粥样硬化.肥胖.慢阻肺.免疫性疾病等等有很多重 ...

[声明]本原创内容只做信息分享,不做任何医疗建议.请随意转发分享,"转载"请私信我. 益生菌在我们体内具有诸多有益作用,包括促进营养素的吸收.增强免疫力.缓解腹泻.维持肠道内平衡和 ...

我百平,我主要从事中药的研究.今天很高兴有机会来到<肠·道>这样一个平台,与大家聊聊中药与肠道菌群. 中医药是中华民族的瑰宝,也在中华民族的繁衍生息中,发挥了重要的作用.中医药有它独特的理 ...

肠道菌群与人体能量代谢马怀幸主治医师肿瘤营养与代谢治疗科中国科技大学附属第一医院西区肠道菌群掌控着人类健康生存的五大基本要素:免疫系统.新陈代谢.激素平衡.认知能力和基因表达.肠道菌群 ...

各行各业,吹牛是一种"本事". "震惊"."重磅"."首次",一年365天,肿瘤能被攻克365次,减肥研究也能突破365 ...

帕金森病是一种影响中枢神经系统的慢性神经退化疾病.在芬兰,约有16,000人患有此病,即每100名65岁的老人中就有1名此病患者. 帕金森病正变得越来越普遍,研究人员预计,到2040年,病例数将增加一 ...

人体微生物组与健康 169篇原创内容公众号肠道微生物组是生活在人体肠道的各种微生物,包括细菌.古菌.病毒及真菌,在宿主健康和疾病中起着关键作用.目前, 大多数研究的人体肠道微生物组来源于粪便, 这 ...

无菌动物(小鼠)基本概念无菌动物指现有检测方法不能检出任何活的微生物和寄生虫的动物."无菌"不是绝对的,只是依据现有技术尚无法检出已知的微生物和寄生虫.即使是SPF级动物也难以排 ...

我们临床采用肠道菌群重建疗法来治疗2型糖尿病以来,很多糖友获得理想的效果,不少糖友甚至逆转达标,平均降低血糖20%.糖化白蛋白34%以上,显著减少胰岛素.口服药使用,改善肠道菌群.但是,很多糖友担心血 ...

如何使用TCGA数据分析肠道菌群