Molecular Plant | 20000个公共拟南芥RNA-Seq的综合在线数据库（超实用、免费、可访问） / 四六文摘

第一单元 lncRNA数据库长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码RNA.研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应.表观遗传调 ...

转录组测序技术 (RNA-seq) 具有广泛的应用,RNA-seq数据分析主要步骤包括实验设计,质量控制,reads比对,基因和转录水平的定量,差异基因表达,可变剪接,功能分析,基因融合检测和eQTL ...

大家可以收藏一下. 数据库介绍 RNA-Seq Atlas - 通过下一代测序在正常组织中进行基因表达谱分析的参考数据库 RNA-Seq Atlas是一个基于网络的RNA-Seq基因表达谱和查询工具库 ...

我们在介绍公共数据库的时候,经常会提到RNA-seq.Chip-seq.甲基化芯片等,对于不了解高通量测序的同学而言,不是很清楚这些都具体是什么.这里就很简单,目的性极强的介绍一下. 测序技术分类高 ...

导语环状RNA(circular RNAs, circRNA)是一类由 mRNA 前体经反向可变剪切而来的共价闭合且保守的单链转录本,长度跨度从几十bp到几千bp,在表观遗传及各种细胞过程中发挥重要 ...

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

Alternative splicing landscapes in Arabidopsis thaliana across tissues and stress conditions highlig ...

推荐:江舜尧编译:厌氧菌编辑:马莉中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所.上海科技大学王佳伟课题组于2019年4月18日在植物学领域顶级期刊<Molecular Plant > ...

编译:微科盟 Nicole,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读拟南芥的昼夜节律控制着许多生理和分子过程,使植物能够预测其环境的每日变化.然而,mRNA水平变化如何与共转录/转 ...

编译:艾奥里亚,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在磷和氮是植物生长和作物生产所必需的常量营养素.在磷饥饿条件下,植物提高了对磷酸盐(Pi)的吸收能力,但降低了对硝酸盐(NO3-) ...

编译:晨晨,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物基因组编码区有很强的保护,不同植物物种的根的结构差异很大,相同物种不同的生态型之间也存在差异.不同生态型植株的非编码RNA进化迅速 ...

编译:YQ,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物根系对于生长发育至关重要,根系吸收养分和水,同时防御土壤微生物.在不断变化的环境压力下,根系进化出复杂的结构,包括不同功能的细胞类 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在拟南芥中,METTL3同源基因mRNA腺苷甲基化酶(MTA)将m6A引入到植物转录组的各种编码和非编码rna中.在本研究中,作者表 ...

编译:Sophie,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读外源细胞分裂素对体外芽再生至关重要.参与细胞分裂素信号转导途径的蛋白质,包括B型拟南芥反应调节因子(ARABIDOPSIS ...

编译:秦时明月,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读基于RNA测序(RNA-seq)的转录组分析已成为现代植物生物学中不可缺少的研究工具.几乎所有的RNA-seq研究都提供了稳态转录 ...

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