RNA-Seq数据用aspera高效批量下载（万事开头难） / 四六文摘

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

导言前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...

当我们需要一些NGS数据时,一般会去NCBI或者EBI的数据库中下载.但是当我们用wget下载时,时常会出现断开连接或者网络下载速度缓慢,对于几十G或者上百G的数据,下载无计可施,这是则可以使用Asp ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

如何高效又简单地省时地获得SRA公共数据的Fastq格式数据陈胖子下载NCBI SRA数据库上的公共数据,整体上还是大部分搞数据分析,又想灌水的人必做的一个事情. 其实直接使用官网推荐的工具asp ...

长期更新列表: 视频讲解-R爬取生信软件列表到思维导图生信技巧第3课-请你务必学好R语言 broad官网出品的必须神器 IGV 资料大全,含视频生信技巧第5课-生信人必须安装的软件好神奇啊,两 ...

前面我们大量NGS相关教程视频免费发布在B站,都是使用NCBI的SRA数据库下载sra文件后转为fastq进行NGS分析流程,其实是因为我本人一直不在中国大陆,所以没有网络问题.但是学生们不一样,同样 ...

写在前面今天课题组师妹与我提到,其要下载Phytozome上的所有数据.这个事情,我在早在几年前干过.不过前年有整了一次.整体简单,以下附上之前的记录. 2017年的记录稍微整理了流程,方便批量下 ...

嘿!持续更新2天,离持续更新目标300天,还有298天. 好多人加了我之后,就问收费吗?我说不收费的模式,当然也会有一点点要求而已,但对于你来说不是门槛. 持续分享出你需要的有价值的东西,也算是一种收 ...

随着互联网的发展,现在很多人都习惯网上购物,让商家费脑的是怎么能一次性批量采集到平台商品图并分类保存到电脑,下面小编给大家介绍一款专业采集图片的工具----网商图片下载工具,我们就以采集京东商城商品图 ...

网商园的知名度虽然不像淘宝京东那样高,但它上面也有着十分丰富的电商资源,我们可以利用这些商品货物信息来获取我们所需要的价值.但要想真正获取到有利用价值的资源却并不是那么的容易,因此我们可以使用一些软件 ...

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