两个样品的10x单细胞转录组数据分析策略 / 四六文摘

细胞外囊泡(EVs)越来越被认为是细胞间通讯的重要载体,并且是生物标记物发现的有希望的来源.由于蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications, PTM)的状态(例 ...

时间慢慢过去了,答应过的事情哭着也要做完,代谢组分析的全套,这次我来送给大家:目前对于使用代谢组发文的数量是越来越多了,真的是一目了然啊,2018年过半,文章的数量已经和2017年差不多了,势头很猛, ...

回首年前开创的单细胞天地公众号,再看看单细胞转录组知识星球的精华资源,一年时间就这样过去了,感慨万千! 单细胞微信交流群大家思想碰撞程度非常激烈和收获巨大,但同时也存在时间利用率不高,重复讨论等弊端. ...

最近读到发表在nature medicine杂志的文章<Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial t ...

四年前我做了一个单细胞课程,就是对scRNAseq包里面的数据示例的一些处理. 不过那个时候的R包的很多函数代码现在都过时了,现在没有学习的价值了哈,但是思路是可取的, 比如我把单细胞转录组数据分析流 ...

总是有粉丝在我们的各个公众号教程下面留言关于单细胞数据处理的细节问题,比如为什么我们过滤线粒体基因表达量超15%的细胞啊,为什么看核糖体基因表达量占比啊等等. 其实看一下基础10讲: 01. 上游分析 ...

都来自于aviv Regev实验室,一系列文章都利用了单细胞转录组数据分析CNV. 2014年关于GBM的science文章首先是2014年关于GBM的science文章:PMID: 2492591 ...

文章是: Reconstruction of developmental landscapes by optimal-transport analysis of single-cell gene ex ...

前面我在单细胞天地分别介绍了如果因为种种原因仅仅是测了一个样本的10X单细胞,或者走经典的2个样本的10X样本该如何分析,并且辅助自己的生物学故事,如下: 我的课题只有一个10x样本肿么办? 两个样品 ...

本教程演示的数据来源于发表在2017年10月的NC文章:Differentiation dynamics of mammary epithelial cells revealed by single- ...

昨天我在单细胞天地的教程:使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本完完整整的展示了如何使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本,因为这个数据集的文章作 ...

两个样品的10x单细胞转录组数据分析策略