生信分析流程构建的几大流派 / 四六文摘

查看配置文件中未被注释的有效配置行大多数的Linux和类Unix系统的配置文件中都有许多的注释行,但是有时候我只想看其中的有效配置行.那我怎么才能只看到quid.conf或httpd.conf这样的 ...

前言当我们自动化代码写完成之后,期望能在不同的环境测试,这时候应该把 base_url 单独拿出来,能通过配置文件和支持命令行参数执行. pytest-base-url 是 pytest 里面提供的 ...

上一期介绍了chfs文档共享服务器部署和使用教程,部署简单且使用方便,受到了很多人的喜爱:本期继续介绍一款跨平台网络文件传输系统kiftd,它既可以作为文件服务器.内部下载站,也可以作为网盘系统使用, ...

本节我们介绍Nextflow中的Combine Operators类型.Combine-operators-合并操作符合并操作符包含以下类型:joincrosscollectFilecombineco ...

本节我们介绍Nextflow中的Splitting operator类型.Splitting operators-分割操作符分割操作符用于将channel中的元素分割成不同的块儿,这些块结构将会下游的 ...

本节我们介绍Nextflow中Transforming operators类型.Transforming operators-转换操作符转换操作符包括buffer, collate, collect, ...

本节我们介绍Nextflow中的Operator类型,Operator用户连接不同的Channel或者按照用户指定的规则进行数据的变换操作. Operators分为以下7种类型: Filtering ...

本节我们介绍Nextflow中的Channel类型,Channel是nextflow中process之间进行数据传递的通道. Channel主要有两个属性: 采用异步操作的方式进行数据传递: 数据接收 ...

在前面的两节内容中我们介绍了Nextflow的安装和流程监控平台Nextflow Tower, 大家如果对软件安装还有疑问可以查阅平台中前面两节的内容.这里我们以nextflow的一个具体运行脚本来进 ...

在第一节中,我们介绍了nextflow的平台支持和安装方法,这一节我们将介绍流程监控的利器nextflow tower. 相信之前自己搭建过生信流程的小伙伴对流程监控的重要性都非常清楚,俗话说:&qu ...

像经常处理生物信息大数据的同学,肯定有自己一套的分析脚本,也就是常说的pipeline了.在我刚开始的时候,也是按照大伙的分析流程,一步一个脚本,后来熟悉了一些,会把经常用到的脚本放在一起,再用变量名 ...

本文介绍「mRNA生信分析流程」 ❞ mRNA生信分析速览 mRNA生信分析主要包含以下各部分. mRNA分析详细步骤数据质控及过滤 FastQC数据质控关注测序数据的碱基质量.GC比等,见上图红 ...

生信分析流程构建的几大流派