KM生存分析如何取最佳的cutoff / 四六文摘

前言年前我提出了一个问题:为什么不用TCGA数据库来看感兴趣基因的生存情况就是一篇文章并没有使用TCGA数据库的指定癌症的生存信息去看自己感兴趣的基因的生存效应,反而舍近求远去下载BMC Canc ...

最近接到粉丝的TCGA分析需求,想看看指定基因在指定癌症是否具有临床意义(也就是生存分析是否有统计学显著效果咯!)其实很早以前我在生信技能树就号召粉丝讨论过这个问题:集思广益-生存分析可以随心所欲根据 ...

导读 (谨以此文献给中医统计界老大哥申杰教授,感谢申哥多年来对松哥统计的关心与支持!) 一谈到ROC曲线,大家本能的就会想到诊断试验,就会想到如何去寻找诊断界值(cut off point). 其实R ...

然后很多粉丝留言说,如果并不是按照表达量中位值或者平均值分组,而是取巧使用了surv_cutpoint这样的函数,得到的结果并不好解释,认为这样的的数据处理方式简直是黑白颠倒! 我看到了这样的留言,确 ...

如果想查看某些因素,如年龄,性别,分期,肿瘤数目,大小,实验室指标或者通过生信手(tao)段(lu)构建的模型和评分是否对预后有影响时候,经常会把连续变量变为分类变量,然后绘制KM曲线或者列线图等 ...

昨天我们提到了任意更改基因表达分组阈值生存分析结果大不一样: 集思广益-生存分析可以随心所欲根据表达量分组吗看到 https://www.proteinatlas.org/ENSG000001118 ...

测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miR ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22422 在本文中,我们描述了灵活的竞争风险回归模型.回归模型被指定为转移概率,也就是竞争性风险设置中的累积发生率.该模型包含Fine和Gray(1 ...

<Frontiers in Oncology>杂志 2021 年4月14日在线发表四川大学华西医院的Jiuhong Li, Qiguang Wang, Menglan Zhang,等撰写的 ...

在医学或者公共卫生研究中,慢性疾病的发生.发展.预后一般不适用于治愈率.病死率等指标来考核,因为其无法在短时间内明确判断预后情况,为此,只能对患者进行长期随访,统计一定时期后的生存或死亡情况以判断诊疗 ...

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在做生信分析的时候,尽管各种分析多到让人眼花缭乱,但是最重要的无外乎表达差异和生存参数,其余都是点缀.表达差异是前提,但是光有表达差异还不行.若A基因在肿瘤和正常组织中表达有差异,但是不影响生存参数, ...

完整原文链接:http://tecdat.cn/?p=5438 生存分析指的是一系列用来探究所感兴趣的事件的发生的时间的统计方法. 生存分析被用于各种领域,例如: 癌症研究为患者生存时间分析, &qu ...

KM生存分析如何取最佳的cutoff