MPB：青岛大学苏晓泉组分享基于分类学和系统发育的宏基因组比较DMS算法 / 四六文摘

编译:微科盟艾奥里亚,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读阿莫西林-克拉维酸(Amoxicillin-clavulanic acid,AMC)是西方世界最常用的抗生素制 ...

病毒是地球上数量最多的生物实体,其中细菌病毒(即噬菌体)约有1031个类群,从海洋到陆地再到人体几乎都是它们的栖息地.研究者将病毒视为调节人类生态系统的重要成员,人体内主要包括真核病毒和噬菌体,包括双 ...

编译:Tigobin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读环状RNA(CircRNAs)是一类有趣的RNA,由于其共价封闭结构.高稳定性和在基因调控中的潜在作用而成为一类有趣的RNA ...

关于宏基因组测序: 直接对提取的全宏基因组DNA建立随机小片段文库,能够获取更多的序列信息.通过组装.ORFs预测与注释,通过各种大型公共数据库进行相应注释,高精度解析微生物群落结构与功能,包括特色的 ...

编译:艾奥里亚,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读物种内的快速进化可以改变群落结构,但这种影响的机制尚不清楚.快速进化出的大量表型多样性种群可能与群落中许多物种相互作用,这对群落 ...

编译:朱雯君,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读乳酸菌(LAB)是发酵食品生产的基础,并且一些乳酸菌菌株是益生菌.发酵食品中活跃着大量的活性乳酸菌,但是文中尚不知道摄入的LAB有 ...

编译:晨晓曦,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读慢性阻塞性肺疾病(COPD)是全球第三大致死原因,表现为一种进行性炎症性肺病,目前尚无有效治疗方法,有研究表明肺部微生物群参与 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读宏基因组由来: 微生物世界是分子多样性最大的天然资源库,基于菌株水平的传统分离培养技术为人们认识微生物多样性提供了可 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读为了研究样品物种组成及多样性信息,我们用Kraken2对所有样品的全部的有效序列进行注释分类.Kraken2是基于K ...

编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读几十年来,16S rRNA基因一直被用来分析细菌物种分类,但是全长16S rRNA基因的高通量测序在近期才可用. 1. 该研究使用 ...

推荐:江舜尧编译:杜如冰编辑:董小橙帕尔玛大学的Gabriele Andrea Lugli等人于2019年5月16日在<Genome Biology>发表题目为<Isolati ...

编译:雪花飘飘,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读尽管微生物基因组数据激增,但对于确认有关微生物的细胞生物学.生态学和进化学依旧需要依赖微生物的细胞分离和培养.目前,由于大多数人 ...

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