STRING：蛋白相互作用数据库的使用 / 四六文摘

●STRING数据库介绍 ● 做科研的时候,为了研究蛋白之间的相互作用网络,我们需要借助一些蛋白质相互作用数据库,而string(Search Tool for the Retrieval of In ...

表达谱数据分析的时候,经常包括各种各样的分析.比如差异表达分析,富集分析,GSEA,蛋白相互作用分析等等等等.NetwordAnalyst(https://www.networkanalyst.ca/ ...

如果有几十个基因或是蛋白,我想制作一个它们间的互作网络图,是不是特别难?我们这种菜鸟级别的,是不是做不了.答案是否定的,现在主流使用R语言来做,但也有很多在线网站可以完成简单这样的分析,今天就给大家介 ...

作图丫聚焦生信技能,前沿文章,个性绘图以及生信技能培训.有兴趣的小伙伴快来关注吧! ---------分割线---------- 对于相互作用分析的而言,我们之前介绍过STRING.BioGRID和C ...

用途:Bazedoxifene hydrochloride (TSE-424 hydrochloride) 是一种有口服活性的,能透过血脑屏障的,非甾体.选择性的雌激素受体调节剂 (SERM),对 E ...

写在前面对于相互作用分析,之前我们介绍过BioGRID以及STRING数据库.这两个数据库主要还是用来分析基因与基因之间的相互作用.我们知道相互作用分析,除了基因和基因之间的相互作用其实还存在比如: ...

导读分子伴侣(Chaperones)是参与新多肽折叠过程的细胞因子,在一些条件下,它们还确保多肽形成更大的复合体.分子伴侣通常需要非客户蛋白质(non-client protein)来为特定目标多肽 ...

功能蛋白质组学是对蛋白质在功能活性水平(例如表达和修饰)的大规模研究.对诸如癌症等复杂疾病的研究表明,遗传改变并不能说明该疾病的所有原因.蛋白质水平和结构的变化也已显示在肿瘤发展和进展中起关键作用,而 ...

DGIdb数据库(Drug-Gene Interaction database),是一个药物-基因相互作用数据库,提供了基因与其已知或潜在药物关联信息,目前已经更新到4.0版本.里面的基因主要是癌基因 ...

导语 EMBL(European Molecular Biology Laboratory)是指欧洲分子生物学实验室,总部位于德国海德堡,1974年由欧洲14个国家加上亚洲的以色列共同发起建立,现在由 ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

写在前面关于探究的蛋白质相互作用的数据库,之前介绍过STRING就是这样的数据库,为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系,主要原因还是STRING支持输入多个基因,寻找 ...

STRING：蛋白相互作用数据库的使用