使用curatedTCGAData下载TCGA数据库信息好用吗 / 四六文摘

MethylMix: an R package for identifying DNA methylation-driven genes. 本文参考:识别甲基化驱动的癌症基因 GetData函数,怎么 ...

近期,中国医学科学院肿瘤医院赫捷院士团队与泛生子合作,在Nature Communications(影响因子12.121)上发表了关于肺肉瘤样癌(PSC)的重磅研究成果,依托泛生子全外显子检测(WES ...

谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...

一份高度定制化个性化的富集分析教程,将解决你做富集分析的全部问题. 写在前面上周末两天,加上这几天每天晚上抽出两个小时,我急行军似的开始构建一套转录组分析流程.因为想到转录组已经很多人发教程了,我虽 ...

写在前面这个包最优雅的地方在于交互式,所以学习的主要目的也就是交互式的实践.交互图可以很好的探索数据,但一般不支持输出矢量图,不方便下游编辑和修改和用于发表.如果你找到了导出矢量图方法,请留言. ...

各位朋友,大家好,又见面了,TCGA的下载我们已经连续分享了3个帖子,分别是官网直接下载,UCSC-XENA下载和cBioportal工具下载,你以为数据下载就结束了吗?不是哦,今天我们继续分享关于T ...

在August 2018文章看到,作者使用了 49 FDA approved drugs to the 5605 tumor samples from 21 cancer types 这样的信息. T ...

如果你不懂代码,不懂网站规则,那么最简单的就是直接使用UCSC xena 浏览器啦!!!网站:https://xenabrowser.net/datapages/ 理论上也可以完成大部分数据探索的,甚 ...

早就告诉圈内好友,我把自己的28篇TCGA教程的部分知识点录制成为了视频,虽然播放量很少,但是看过的朋友都说收获很大,而且还有专门的笔记系统性介绍自己学习的收获,今天我们就分享其中一位优秀学员的笔记: ...

半年前我就系统性的介绍过:TCGA的pan-caner资料大全(以后挖掘TCGA数据库就用它) 还专门指出了癌症的somatic突变的maf文件问题:TCGA数据库maf突变资料官方大全但是最近收到 ...

物业名称Property name描述Description种类kind资源类型.The resource type.等份[]aliquots[]从该参与者处提取的等分条形码的列表.List of b ...

分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...

让我们一起科研吧~ 小燕子肿瘤微环境是当前研究的一个热点,无论是国自然还是发SCI,都是比较热的点,那么,数据挖掘也不例外,很多人喜欢追随这样的热点.(肿瘤微环境是指肿瘤的发生.生长及转移与肿瘤细胞 ...

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