泛癌全基因数据分析工具推荐:ICGC / 四六文摘

数据挖掘是一门随着计算机科学发展而快速发展的学科,其在生命科学领域的作用随着大量测序数据的累计而逐渐显现. 1 生存分析生存分析是一类用于计算在一个集合内对于给定的时间段中影响因素与给定结果或时间 ...

写在前面最近做了一些转录组数据分析.想想,上一次这么精细地分析转录组数据,都是三五年前的事情.整个实验设计是一个器官的不同发育阶段.按照最传统的做法,不同阶段,两两间进行差异表达分析,于是会产生系列 ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起.早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标.从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展 ...

TCGA的Pan-Cancer早在2013就系统性提出来并且规划好了,见Nat. Genet. 2013 45:1113), 因为TCGA计划涉及到数据类型比较多,仅仅是DNA层面就有WGS,WES, ...

前两天我们介绍了一下刚刚发表的泛癌的全基因组在线数据工具汇总的文章.同时也介绍了一下关于ICGC的使用,在那个文章里面提到了五个在线分析PCAWG的工具,今天就来介绍另外一个:UCSC XENA. 1 ...

所谓的泛癌分析我们都知道在TCGA数据库当中,包括了33种所有实体肿瘤的测序的结果(如果不知道的话,可以看我们今天的第二条推送哦!).我们在进行TCGA数据分析的时候,除了可以对单一的癌种进行分析之 ...

来源:CSDN博主「BAZHUAYUdata」作者阿什利·韦尔登 Part 1:数据采集工具 1 .八爪鱼八爪鱼是一款免费的.简单直观的网页爬虫工具,无需编码即可从许多网站抓取数据.无论你是初学者 ...

2021年4月27日"数字探索触手可及"永洪科技新品发布会在北京成功举办. 发布会上,永洪科技面向个人用户带来了一款颠覆行业,人人都可轻松上手使用的桌面智能数据分析工具--Yon ...

2021年4月16日-18日,由动脉网主办,苏州市吴江区人民政府.广东省钟南山医学基金会联合主办,苏州市吴江东方国有资本投资经营有限公司协办,阿里健康作为独家战略合作伙伴的"第五届未来医疗1 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

泛癌全基因数据分析工具推荐:ICGC