聊UCSC xena的数据下载问题 / 四六文摘

写在前面前几天我们介绍了UCSC XENA的基本使用过程.今天我们就基于UCSC XENA来简单的设计一个简单的课题. 之前在介绍ICGC数据库使用的时候,我们可以通过ICGC数据库来进行整个基因组 ...

gtf文件大家都了解,基因或者外显子的坐标相对独立,但是转录本很不一样,同一个基因的不同转录本共用外显子,这样的话它们的坐标其实很多都是overlap的,这样,我们的二代测序的100bp或者150bp ...

学TCGA数据库并不是为了发"套路"文章,那些基本上是本科生毕业设计的水准,但是阅读这样的文章的确可以很大程度上帮助大家认识TCGA数据库,主要是了解它可以做什么,比如我昨天在生信 ...

如果你不懂代码,不懂网站规则,那么最简单的就是直接使用UCSC xena 浏览器啦!!!网站:https://xenabrowser.net/datapages/ 理论上也可以完成大部分数据探索的,甚 ...

学徒已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是赵婧的分享 TCGA 数据下载今天听完生信技能树的TCGA课程后,尝试完成课程作业,通过GDCRNATools下载TCGA数据的时候出现 ...

前两天我们介绍了一下刚刚发表的泛癌的全基因组在线数据工具汇总的文章.同时也介绍了一下关于ICGC的使用,在那个文章里面提到了五个在线分析PCAWG的工具,今天就来介绍另外一个:UCSC XENA. 1 ...

不知道为什么总是有人问我TCGA数据下载这么简单的问题,这问题简单到如何下载人类的hg19.fa这个参考基因组一下,就是http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenpat ...

文章分类链接数据透视谈笑间,函数灰飞烟灭数据透视各种分析角度,想咋看就咋看数据透视不只是求和,还有各种花样儿数据透视切片器,让领导也爱上透视数据透视组合,数据合并统计你莫愁! 数 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

GPM降水数据下载 GPM降水只有08-08的降水: 相关连接http://blog.sina.com.cn/s/blog_b3fc09530102xiuz.html https://blog.cs ...

好奇心Log 今天以下文章来源于GIS前沿 ,作者邢愿 GIS前沿分享测绘地信资讯,交流行业软件技巧. 1 数据获取打开任何一个浏览器搜"地理空间数据云"或者在网页地址处输入网 ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

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