R语言用igraph绘制网络图可视化 / 四六文摘

本次更新去除对microbiomeSeq的依赖: 因为这个包目前在github上,bioconductor上的不好用. 写在前面网络整体属性 - 平均度(Average degree)和平均加权度 ...

原文 Model 作者 JoeyDeVries 翻译 Django 校对 Geequlim 现在是时候着手启用Assimp,并开始创建实际的加载和转换代码了.本教程的目标是创建另一个类,这个类可以表达 ...

-- 微资讯 · 微课程 -- 利用零碎时间,走上超神之路! 如果有其他软件三维经验的同学应该知道几何体的基本关系是点→线→面→几何体,maya会有vertice顶点.但是对于houdini来说, ...

写在前面 outputgephi函数:可以使用相关矩阵和微生物群落的phyloseq对象直接生成Gephi软件需要两个文件,直接保存即可. nodeEdge函数:可以生成边文件和节点文件,用于制作gg ...

写在前面之前我看到microbiomeSeq编写了这些函数,同时将zipi plot做的更加精细一些,但是代码实在是太难用了,尤其是包冲突事件实在是太多,所以我不得已将他的函数做了修改,并放到ggC ...

一般来说,公共数据集都会给出表达量矩阵和具体不同细胞亚群特异性基因,比如 GSE122083 数据集背后的文献,就给出来了这些分群: NK (NKG7 and GNLY), NKT (CD3D and ...

小绿最近在学习视觉SLAM十四讲里面的程序,前两天跑来问我关于g2o优化库怎么使用,这两天小白整理网上的一些资料,与小伙伴分一起分享一下. g2o整体架构首先来看一张关于g2o整体结构的结构图这张 ...

为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理(PLUS).建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt ...

本文由yang根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在组学数据挖掘中在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是G ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读饼图可以展示整体中各个部分占整体的比例.利用label,col,border可分别调整pie图的标签.饼颜色.边颜色 ...

最近在练习R实现相关分析,不试一下不知道,用R去做一个相关系数矩阵以及显著性检验,还这么麻烦,输出的结果也并不能灵活的展示,如果和SPSS或JASP相比的话,的确不怎么方便. 案例数据:犯罪数据sta ...

从R语言介绍与安装,再到出一个能看的热图前面用Excel绘制热图,在熟练的情况下,操作起来其实还是比较快速和方便的,尤其对于具有代码恐惧症的朋友.教程发出去之后,即有收到消息,希望能写一个用R语言绘 ...

天道昭然12020.04.18 18:28:11字数 1,383阅读 16,602原文:R语言 | forestplot包绘制森林图在Meta分析中森林图比较常见,但其实掌握了用R语言中的forest ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=12299 最近我们一直在探索空间数据.事实证明,有一些很棒的R包可用于可视化此类数据. 以下是我汇总的一组图表. 每次shooting的位置在下面的 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=17654 在现实世界中,我们的生活受到大量网络的支配.网络流可以表示很多模型,比如管道中的石油.高压线中电流,或者计算机网络中的数据.网络流也可以解 ...

火山图火山图(volcano plot)常用于显著差异基因表达的展示,包含显著和差异两个重要信息.显著性指P值小于0.05,差异性常用FoldChange值>=2作为筛选标准. 那么如何看懂一 ...

R语言用igraph绘制网络图可视化