植物基因组文件下载 / 四六文摘

写在前面今天课题组师妹与我提到,其要下载Phytozome上的所有数据.这个事情,我在早在几年前干过.不过前年有整了一次.整体简单,以下附上之前的记录. 2017年的记录稍微整理了流程,方便批量下 ...

写在前面课题组目前做一些基因组相关工作.了解基因组的朋友应该明白,基因结构注释错误几乎遍布所有基因组,包括我们目前看到的大多数即使是发表在顶级期刊的工作.生物是复杂的,而算法是存在局限的.所以人工矫 ...

写在前面高通量测序技术普及,大量物种基因组被测序.组装质量逐步提高,但基因结构注释的质量则一如既往的让人担心.错误的基因结构注释,可能会使得你得到错误的结果.比如: 不准确的基因结构注释,使得编码蛋 ...

写在前面高通量测序已然成为qPCR一样普及到几乎每一个实验室.大量的物种被测序,对这些物种的序列信息进行分析,有助于我们更多地认识生物演化,预测更甚至了解基因的功能. 基于我个人的说法, 基因只是一 ...

写在前面近年来,高通量测序费用持续走低.大多数课题组完全有经费可以支撑起自己所研究材料的基因组测序更或者可以非常容易地从网络上获取基因组序列与基因结构注释信息.于是会开始存在这样那样的,关于比较基因 ...

题记为什么加这个工具?最近硕士毕业,手上课题也多,两边实验室的事情同时操作,我觉得我个人精力没问题,但是两边进展都很缓慢....心累.心累那就码码,做点课题组需要的东西,于是就写这个.总的来说,首先 ...

写在前面伴随着越来越多的全基因组序列公布,比较基因组分析已然常规生信数据分析技能.MCScan 是最为常用的软件之一.久前,TBtools 已经将该软件打包,同时开放了一键化流程.用户只需要输入四个 ...

写在前面近期课题需要,要计算超大量,反正是很多基因对的Ka/Ks值,于是我实现了这么一个功能,顺便打了一个GUI,毕竟现在很多时候,我涉及的生信分析,都是在windows下面做,或者说使用界面做的. ...

写在前面这两天有看到几个用户朋友在生信札记讨论群中讨论了基因结构图的绘制.看到其他用户一直推荐 GSDS,我便也没有作声,毕竟 GSDS 确实是很优秀的网页软件.而现实情况是,近期 GSDS 网站无 ...

来源:<中国科学报>2021-05-11 09:14 近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心韩斌院士团队与英国约翰·英纳斯中心研究团队合作,完成了禾本科.燕麦属一年生草本植物二倍体燕 ...

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